294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1420 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 558 aa  1122    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  37.24 
 
 		 490 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  37.24 
 
 		 491 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  37.9 
 
 		 504 aa  284  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  38.36 
 
 		 489 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  38.36 
 
 		 489 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  38.28 
 
 		 490 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  38.16 
 
 		 489 aa  282  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  36.21 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  36.21 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  36.21 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  36.63 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  36.21 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  34.43 
 
 		 527 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  36.21 
 
 		 461 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  36.21 
 
 		 461 aa  274  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  36.63 
 
 		 461 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  36.21 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  38.02 
 
 		 489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  40.35 
 
 		 432 aa  273  6e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  36.15 
 
 		 489 aa  273  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  36.42 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  36.6 
 
 		 501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  36.04 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  36.04 
 
 		 501 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  36.93 
 
 		 501 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  36.51 
 
 		 501 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  35.28 
 
 		 500 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  36.66 
 
 		 477 aa  258  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  35.07 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  36.67 
 
 		 497 aa  257  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  32.1 
 
 		 544 aa  256  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  34.85 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  38.72 
 
 		 467 aa  253  7e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  35.48 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  35.97 
 
 		 479 aa  249  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  38.25 
 
 		 444 aa  249  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  35.12 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  31.63 
 
 		 603 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  33.95 
 
 		 461 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  33.74 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  33.74 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  32.57 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  33.62 
 
 		 516 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  34.55 
 
 		 544 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  33.47 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  34.48 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  34.48 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  31.48 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  31.51 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  35.17 
 
 		 499 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  32.62 
 
 		 510 aa  227  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  32.81 
 
 		 510 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  35.14 
 
 		 501 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  32.73 
 
 		 502 aa  224  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  32.05 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  31.32 
 
 		 603 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  33.06 
 
 		 449 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  33.26 
 
 		 449 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  33.26 
 
 		 449 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  32.26 
 
 		 499 aa  220  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  30.47 
 
 		 539 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  30.94 
 
 		 539 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  30.47 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  30.47 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  33.4 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  34.06 
 
 		 395 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  33.4 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  29.42 
 
 		 533 aa  216  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  32.76 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  32.36 
 
 		 501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  32.36 
 
 		 501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  36.34 
 
 		 584 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  31.65 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  31.62 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  33.48 
 
 		 498 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  31.18 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  33.61 
 
 		 528 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  29.46 
 
 		 497 aa  203  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  31.89 
 
 		 497 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  32.84 
 
 		 497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  33.47 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  31.83 
 
 		 483 aa  199  9e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  33.26 
 
 		 516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  31.34 
 
 		 483 aa  197  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  30.13 
 
 		 566 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  29.75 
 
 		 501 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  28.36 
 
 		 492 aa  195  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  28.18 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  28.27 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  34.62 
 
 		 324 aa  192  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  31.1 
 
 		 517 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  32.01 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  32.01 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  32.1 
 
 		 498 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  30.48 
 
 		 501 aa  187  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  31.28 
 
 		 489 aa  187  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  30.11 
 
 		 486 aa  186  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  30.71 
 
 		 517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  30.06 
 
 		 498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>