More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5954 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1006    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  54.08 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  48.6 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  48.47 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  48.65 
 
 		 498 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  42.65 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  44.11 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  41.12 
 
 		 497 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  44.26 
 
 		 490 aa  365  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  44.79 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  42.57 
 
 		 498 aa  362  6e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  39.88 
 
 		 495 aa  362  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  39.68 
 
 		 501 aa  356  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  39.68 
 
 		 501 aa  356  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  43.56 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  42.27 
 
 		 495 aa  351  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  43.23 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  42.22 
 
 		 497 aa  347  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  42.28 
 
 		 482 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  43.39 
 
 		 498 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  40.75 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  39.14 
 
 		 507 aa  324  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  44.42 
 
 		 482 aa  323  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  39.04 
 
 		 484 aa  319  7e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  38.19 
 
 		 501 aa  319  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  39.96 
 
 		 486 aa  302  8.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  39.47 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  38.22 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  40.82 
 
 		 528 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  37.58 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  38.46 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  37.95 
 
 		 516 aa  296  6e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  36.85 
 
 		 479 aa  296  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  38.01 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  38.01 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  37.5 
 
 		 524 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  37.48 
 
 		 520 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  38.19 
 
 		 511 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  35.68 
 
 		 462 aa  269  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  36.1 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  35.86 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  34.76 
 
 		 451 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  34.97 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  34.36 
 
 		 446 aa  259  9e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  34.36 
 
 		 446 aa  259  9e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  35.31 
 
 		 490 aa  258  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  34.12 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  32.33 
 
 		 539 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3675  Dipeptide/tripeptide permease-like protein  34.84 
 
 		 520 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.59 
 
 		 516 aa  251  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  31.95 
 
 		 539 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  31.71 
 
 		 539 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  31.71 
 
 		 539 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  35.38 
 
 		 516 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  33.13 
 
 		 501 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  35.75 
 
 		 527 aa  246  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  34.14 
 
 		 544 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  33.6 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  34.84 
 
 		 489 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  35.79 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  32.13 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  34.13 
 
 		 501 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  32.4 
 
 		 533 aa  244  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  34.84 
 
 		 489 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  34.84 
 
 		 489 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  33.92 
 
 		 510 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  32.28 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  33.27 
 
 		 544 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  33.82 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  32.66 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  35.4 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  33.98 
 
 		 510 aa  233  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  32.93 
 
 		 500 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  32.72 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  32.1 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  31.89 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  31.89 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  31.89 
 
 		 461 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  31.89 
 
 		 461 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  31.89 
 
 		 461 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  31.89 
 
 		 461 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  31.89 
 
 		 461 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  29.08 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  30.72 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  29.08 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  29.08 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  29.08 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  28.88 
 
 		 501 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  29.74 
 
 		 500 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  30.65 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  30.65 
 
 		 511 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  31.05 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  30.65 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  29.27 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  32.24 
 
 		 506 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  29.27 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  29.4 
 
 		 506 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  29.18 
 
 		 461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>