273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1105 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  76.47 
 
 		 544 aa  842    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  100 
 
 		 544 aa  1090    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  50 
 
 		 534 aa  485  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  50.28 
 
 		 539 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  50.09 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  50.46 
 
 		 539 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  50.46 
 
 		 539 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  45.6 
 
 		 516 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  45.07 
 
 		 516 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  44.74 
 
 		 527 aa  411  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  42.71 
 
 		 603 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0374  amino acid/peptide transporter  39.03 
 
 		 627 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  37.46 
 
 		 603 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  53.35 
 
 		 584 aa  348  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  33.94 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  33.63 
 
 		 510 aa  282  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  36.98 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  36.8 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  36.46 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  36.46 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  37.87 
 
 		 479 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  35.62 
 
 		 462 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  36.15 
 
 		 490 aa  278  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  35.25 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  36.1 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  35.48 
 
 		 501 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  35.48 
 
 		 501 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  35.04 
 
 		 489 aa  276  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  35.78 
 
 		 490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  37.82 
 
 		 504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  34.14 
 
 		 462 aa  273  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  35.19 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  34.83 
 
 		 500 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  34.86 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  34.86 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  35.41 
 
 		 489 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  34.86 
 
 		 489 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  34.81 
 
 		 461 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  34.34 
 
 		 533 aa  264  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  33.87 
 
 		 501 aa  263  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  31.05 
 
 		 497 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  33.93 
 
 		 461 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  34.1 
 
 		 461 aa  259  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  33.93 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  33.75 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  33.75 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  33.75 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  33.75 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  33.75 
 
 		 461 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  32.98 
 
 		 502 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  33.75 
 
 		 461 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  34.75 
 
 		 498 aa  256  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  34.37 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  32.91 
 
 		 451 aa  256  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  33.33 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  34.77 
 
 		 444 aa  255  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  34.09 
 
 		 492 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  34.09 
 
 		 492 aa  254  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  34.37 
 
 		 461 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  33.79 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  32.56 
 
 		 499 aa  249  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  30.78 
 
 		 497 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  31.82 
 
 		 499 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  34.14 
 
 		 509 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  35.36 
 
 		 517 aa  246  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  34.2 
 
 		 501 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  35.05 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  30.04 
 
 		 494 aa  243  9e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  32.02 
 
 		 495 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  34.61 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  34.61 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  32.41 
 
 		 507 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  30.28 
 
 		 495 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  34.38 
 
 		 517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  34.33 
 
 		 477 aa  234  4.0000000000000004e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  30.62 
 
 		 495 aa  232  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  34.1 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  34 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  32.04 
 
 		 463 aa  230  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  33.66 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  32.53 
 
 		 558 aa  229  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0163  amino acid/peptide transporter  37.53 
 
 		 707 aa  229  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  31.36 
 
 		 493 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  31.36 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  31.36 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  31.36 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  31.36 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  34.18 
 
 		 449 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  34.31 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  34.31 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  34.58 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  30.71 
 
 		 566 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  33.95 
 
 		 528 aa  226  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  32.91 
 
 		 512 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  32.91 
 
 		 512 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  36.07 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  31.26 
 
 		 496 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  32.04 
 
 		 516 aa  223  7e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  31.2 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  31.2 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>