286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0984 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  100 
 
 
483 aa  954    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  57.84 
 
 
498 aa  527  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  59.3 
 
 
490 aa  521  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  55.11 
 
 
499 aa  510  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  51.66 
 
 
497 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  50.21 
 
 
497 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  48.54 
 
 
495 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  52.16 
 
 
498 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  47 
 
 
497 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  42.07 
 
 
501 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  42.07 
 
 
501 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  41.94 
 
 
501 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  41.56 
 
 
499 aa  355  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  42.62 
 
 
489 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  43.56 
 
 
509 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  39.59 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  41.65 
 
 
486 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  40.12 
 
 
482 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  39.75 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  40.17 
 
 
482 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  37.97 
 
 
511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  36.29 
 
 
501 aa  297  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  37.7 
 
 
495 aa  286  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  36.82 
 
 
497 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  36.03 
 
 
517 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  35.37 
 
 
517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  37.77 
 
 
528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  36.95 
 
 
498 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  37.5 
 
 
520 aa  266  5e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  33.6 
 
 
507 aa  262  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  35.18 
 
 
512 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  36.65 
 
 
524 aa  260  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  35.18 
 
 
512 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  34.48 
 
 
517 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  34.36 
 
 
516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  37.67 
 
 
483 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  36.16 
 
 
501 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  34.78 
 
 
444 aa  250  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  34 
 
 
527 aa  248  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  32.67 
 
 
462 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  32.48 
 
 
462 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  33.07 
 
 
489 aa  237  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  34.26 
 
 
516 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  33.06 
 
 
461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  34.59 
 
 
510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  33.74 
 
 
479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  34.87 
 
 
516 aa  234  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  33.54 
 
 
534 aa  233  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  34.99 
 
 
510 aa  233  6e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  34.17 
 
 
539 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  34.51 
 
 
432 aa  231  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  31.81 
 
 
461 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  31.81 
 
 
461 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  34.17 
 
 
539 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  31.81 
 
 
461 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  31.81 
 
 
461 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  34.17 
 
 
539 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  31.81 
 
 
461 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  32.68 
 
 
490 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  34.17 
 
 
539 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  31.81 
 
 
461 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  32.75 
 
 
491 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  32.3 
 
 
501 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  31.81 
 
 
461 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  32.42 
 
 
489 aa  230  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  31.38 
 
 
500 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  31.61 
 
 
461 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  31.81 
 
 
461 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  32.99 
 
 
446 aa  228  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  32.99 
 
 
446 aa  228  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  32.02 
 
 
489 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  32.02 
 
 
489 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  34.77 
 
 
477 aa  229  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  32.24 
 
 
501 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  32.21 
 
 
461 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  32.46 
 
 
451 aa  227  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  31.93 
 
 
501 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  32.43 
 
 
501 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  33.07 
 
 
463 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  32.52 
 
 
533 aa  225  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  35.74 
 
 
502 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  31.7 
 
 
490 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  31.91 
 
 
489 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  30.81 
 
 
501 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  31.98 
 
 
492 aa  217  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  31.77 
 
 
492 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  33.2 
 
 
449 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  33.2 
 
 
449 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  34.71 
 
 
504 aa  216  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  32.05 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  34.2 
 
 
499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  32.57 
 
 
449 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  32.93 
 
 
544 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  32.57 
 
 
449 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  32.8 
 
 
497 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  33.41 
 
 
452 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  33.41 
 
 
452 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  31.29 
 
 
467 aa  201  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  31.66 
 
 
461 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  31.7 
 
 
544 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>