More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01330 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  92.24 
 
 		 462 aa  859    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  935    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  74.83 
 
 		 451 aa  689    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  61.73 
 
 		 501 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  62.35 
 
 		 501 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  62.14 
 
 		 501 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  63.69 
 
 		 489 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  63.69 
 
 		 489 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  63.48 
 
 		 489 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  62.14 
 
 		 500 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  64.09 
 
 		 489 aa  585  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  64.05 
 
 		 490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  63.44 
 
 		 491 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  63.81 
 
 		 490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  63.5 
 
 		 489 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  62.55 
 
 		 501 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  61.11 
 
 		 501 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  57.42 
 
 		 479 aa  531  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  47.07 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  47.07 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  47.61 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  47.29 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  47.29 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  47.29 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  47.61 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  47.39 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  47.29 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  47.39 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  48.02 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  44.42 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  44.64 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  45.67 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  47.32 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  44.86 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  62.97 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  45.39 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  45.39 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  47.73 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  45.41 
 
 		 449 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  45.41 
 
 		 449 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  44.97 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  45.19 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  47.08 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  45.66 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  44.89 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  43.76 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  43.76 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  44.09 
 
 		 436 aa  346  4e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  44.02 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  47.45 
 
 		 395 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  39.27 
 
 		 501 aa  320  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  40.91 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  38.61 
 
 		 527 aa  316  7e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  37.55 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  36.44 
 
 		 495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  36.58 
 
 		 517 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  38.99 
 
 		 497 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  35.03 
 
 		 495 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  35.38 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  38.76 
 
 		 498 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  34.13 
 
 		 497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  36.75 
 
 		 496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  36.85 
 
 		 544 aa  283  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  37.35 
 
 		 516 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  37.77 
 
 		 510 aa  282  9e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  37.45 
 
 		 510 aa  280  4e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  37.83 
 
 		 499 aa  280  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  36.61 
 
 		 516 aa  279  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  36.89 
 
 		 520 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  36.18 
 
 		 524 aa  276  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  35.48 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  37.32 
 
 		 544 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  32.66 
 
 		 501 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  32.66 
 
 		 501 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  35.11 
 
 		 512 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  35.11 
 
 		 512 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  37.7 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  35.29 
 
 		 483 aa  256  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 		 499 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  35.46 
 
 		 497 aa  249  6e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  34.31 
 
 		 490 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  32.21 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  42.33 
 
 		 533 aa  244  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  36.41 
 
 		 445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  32.25 
 
 		 501 aa  242  7.999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  32.48 
 
 		 483 aa  239  5e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  32.42 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  33.61 
 
 		 489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  34.48 
 
 		 482 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  32.78 
 
 		 566 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  31.78 
 
 		 497 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  31.35 
 
 		 486 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  31.22 
 
 		 511 aa  220  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  32.21 
 
 		 517 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  32 
 
 		 516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  30.43 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  30.43 
 
 		 500 aa  209  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  30.43 
 
 		 500 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  28.63 
 
 		 501 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>