More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1421 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  66.6 
 
 		 497 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 494 aa  987    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  33.88 
 
 		 527 aa  276  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  33.21 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  34.85 
 
 		 510 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  32.7 
 
 		 516 aa  266  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  34.52 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  35.4 
 
 		 499 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  33.67 
 
 		 501 aa  254  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.47 
 
 		 483 aa  249  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  33.94 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  30.99 
 
 		 544 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  33.26 
 
 		 497 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  32.75 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  32.73 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  31.59 
 
 		 517 aa  240  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  33.88 
 
 		 495 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  30.82 
 
 		 544 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  34.35 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  32.93 
 
 		 501 aa  230  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  28.92 
 
 		 534 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  27.68 
 
 		 506 aa  226  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  30.08 
 
 		 507 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  27.13 
 
 		 506 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  31.05 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  34.25 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  28.79 
 
 		 539 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  28.79 
 
 		 539 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  28.79 
 
 		 539 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  32.82 
 
 		 496 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  31.69 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  32.67 
 
 		 489 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  28.79 
 
 		 539 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  31.73 
 
 		 501 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  31.53 
 
 		 501 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  31.53 
 
 		 501 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  27.38 
 
 		 502 aa  219  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  31.69 
 
 		 489 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  31.69 
 
 		 489 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  32.71 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  33.91 
 
 		 507 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  33.48 
 
 		 490 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  27.79 
 
 		 501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  27.79 
 
 		 501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  27.79 
 
 		 501 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  27.64 
 
 		 500 aa  216  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  27.64 
 
 		 500 aa  216  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  27.44 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  27.44 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  27.59 
 
 		 501 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  27.59 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  27.44 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  27.44 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  27.44 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  27.44 
 
 		 500 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  31.49 
 
 		 490 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  33.12 
 
 		 501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  27.44 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  28.63 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  30.97 
 
 		 528 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  31 
 
 		 500 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  28.48 
 
 		 490 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  30.66 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  32.91 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  35.81 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  30.44 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  29.4 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  30.04 
 
 		 462 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  31.05 
 
 		 520 aa  209  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  28.81 
 
 		 492 aa  209  7e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  28.6 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  31.09 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  28.22 
 
 		 546 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  31.09 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  31.75 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  33.18 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  31.75 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  29.74 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  28.01 
 
 		 516 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  29.82 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  28.01 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  27.8 
 
 		 516 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  28.01 
 
 		 516 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  31.18 
 
 		 558 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  27.86 
 
 		 517 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  27.62 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  27.62 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  27.62 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  27.49 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  27.62 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  25.67 
 
 		 500 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  27.49 
 
 		 511 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  27.62 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  27.62 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  27.62 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  33.41 
 
 		 497 aa  204  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  28.07 
 
 		 490 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  27.62 
 
 		 489 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  27.62 
 
 		 489 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>