274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2992 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  98.06 
 
 		 516 aa  1033    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  94.2 
 
 		 517 aa  977    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  93.81 
 
 		 517 aa  991    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  99.61 
 
 		 516 aa  1046    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 516 aa  1048    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  93.47 
 
 		 521 aa  974    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  99.81 
 
 		 516 aa  1046    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  82.41 
 
 		 506 aa  864    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  96.91 
 
 		 546 aa  1023    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  93.81 
 
 		 523 aa  991    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  59.88 
 
 		 507 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  57.37 
 
 		 506 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  58.27 
 
 		 513 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  58.46 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  58.54 
 
 		 551 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  57.93 
 
 		 551 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  56.97 
 
 		 506 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  57.72 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  58.9 
 
 		 506 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  58.9 
 
 		 506 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  57.72 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  57.72 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  57.93 
 
 		 500 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  57.93 
 
 		 500 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  57.72 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  58.9 
 
 		 506 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  58.49 
 
 		 506 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  57.8 
 
 		 507 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  39.64 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  40.83 
 
 		 528 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1189  amino acid/peptide transporter  45.8 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.500547 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  40.63 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  38.02 
 
 		 501 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  38.03 
 
 		 501 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  38.03 
 
 		 501 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  38.03 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  38.03 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  38.8 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  39.35 
 
 		 506 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  39.19 
 
 		 490 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  39.19 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  39.19 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  39.19 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  38.08 
 
 		 489 aa  346  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  38.08 
 
 		 489 aa  346  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  38.08 
 
 		 489 aa  346  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  37.04 
 
 		 500 aa  346  6e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  38.87 
 
 		 506 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  37.88 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  37.88 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  37.88 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  37.88 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  37.88 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  36.84 
 
 		 500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  36.84 
 
 		 500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  36.84 
 
 		 500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  36.84 
 
 		 500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  36.84 
 
 		 500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  36.64 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  36.64 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  37.88 
 
 		 489 aa  343  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  36.64 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  37.65 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  38.31 
 
 		 514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  36.56 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  36.56 
 
 		 511 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  36.65 
 
 		 488 aa  323  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  36.09 
 
 		 506 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  35.82 
 
 		 500 aa  316  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  36.02 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  28.01 
 
 		 494 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  30.12 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  30.12 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  29.92 
 
 		 485 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  29.92 
 
 		 485 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  29.92 
 
 		 485 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  29.92 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  29.92 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  29.72 
 
 		 485 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  29.88 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  29.88 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  26.83 
 
 		 516 aa  192  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  28.27 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  31.15 
 
 		 510 aa  191  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  28.31 
 
 		 493 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  28.31 
 
 		 493 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  28.57 
 
 		 509 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  28.31 
 
 		 493 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  28.31 
 
 		 493 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  28.31 
 
 		 493 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  26.57 
 
 		 527 aa  189  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  29.08 
 
 		 482 aa  189  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  28.02 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  29.35 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  28.23 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  28.23 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  27.62 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  28.23 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  28.72 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  28.23 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>