276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1088 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 584 aa  1149    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  46.6 
 
 		 544 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  60.95 
 
 		 534 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  58.84 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  59.04 
 
 		 539 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  59.04 
 
 		 539 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  59.04 
 
 		 539 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  40.24 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  52.6 
 
 		 544 aa  340  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  37.39 
 
 		 527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  45.43 
 
 		 516 aa  302  9e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0374  amino acid/peptide transporter  33.39 
 
 		 627 aa  290  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  32.82 
 
 		 603 aa  283  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0163  amino acid/peptide transporter  33.48 
 
 		 707 aa  280  5e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  31.89 
 
 		 495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  29.23 
 
 		 584 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  30.77 
 
 		 566 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  31.86 
 
 		 496 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  29.25 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  29.78 
 
 		 498 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  31.02 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  37.31 
 
 		 497 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  29.77 
 
 		 517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  27.63 
 
 		 495 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  32.03 
 
 		 483 aa  196  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  29.39 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  28.64 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  29.39 
 
 		 493 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  29.39 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  29.39 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  29.39 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  31.98 
 
 		 483 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  46.58 
 
 		 446 aa  190  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  46.58 
 
 		 446 aa  190  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  28.55 
 
 		 486 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2761  inner membrane transporter YbgH  28.55 
 
 		 486 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  28.55 
 
 		 486 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2823  inner membrane transporter YbgH  28.55 
 
 		 486 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  28.55 
 
 		 486 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  46.9 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  26.41 
 
 		 507 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  27.79 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  27.79 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  27.61 
 
 		 493 aa  187  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  27.61 
 
 		 493 aa  187  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  27.61 
 
 		 493 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  27.61 
 
 		 493 aa  186  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  27.61 
 
 		 493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  27.61 
 
 		 493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  28.29 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  28.29 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  30.77 
 
 		 489 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0626  amino acid/peptide transporter  27.43 
 
 		 493 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  28.39 
 
 		 485 aa  183  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  28.39 
 
 		 485 aa  183  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  28.39 
 
 		 485 aa  183  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  28.39 
 
 		 485 aa  183  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  28.21 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  28.26 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  43.88 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  28.21 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  35.69 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  28.26 
 
 		 485 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  38.12 
 
 		 509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  34.93 
 
 		 495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  29.64 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  42.92 
 
 		 471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  46.34 
 
 		 462 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  29.58 
 
 		 489 aa  181  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  43.91 
 
 		 490 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  35.91 
 
 		 482 aa  181  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  29.41 
 
 		 489 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  29.41 
 
 		 489 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  30.51 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  29.54 
 
 		 461 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  42.99 
 
 		 533 aa  179  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  35.06 
 
 		 501 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  32.56 
 
 		 492 aa  178  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  32.3 
 
 		 492 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  42.45 
 
 		 436 aa  176  7e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  45.59 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  29.2 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  29.2 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  28.52 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  29.2 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  29.2 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  29.2 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  29.35 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  29.2 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  28.69 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  28.86 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  34.18 
 
 		 497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  43.98 
 
 		 432 aa  173  6.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  43.58 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  26.06 
 
 		 507 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  33.59 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  28.45 
 
 		 501 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  32.26 
 
 		 683 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  32.09 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  31.74 
 
 		 516 aa  168  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>