295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  100 
 
 		 511 aa  988    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  53.39 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  52.8 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  50.11 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  51.91 
 
 		 484 aa  458  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  50.95 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  40.21 
 
 		 498 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  40.17 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  39.11 
 
 		 497 aa  338  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  38.33 
 
 		 495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  39.02 
 
 		 499 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  37.97 
 
 		 483 aa  313  5.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  37.7 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  38.7 
 
 		 501 aa  306  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  38.7 
 
 		 501 aa  306  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  38.49 
 
 		 497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  39.68 
 
 		 496 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  34.62 
 
 		 499 aa  289  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  36.31 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  38.32 
 
 		 509 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  35.66 
 
 		 501 aa  276  7e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  35.97 
 
 		 528 aa  253  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  36.31 
 
 		 524 aa  252  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  34.74 
 
 		 501 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  35.12 
 
 		 495 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  34.29 
 
 		 507 aa  251  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  38.58 
 
 		 498 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  35.47 
 
 		 520 aa  239  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  33.61 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  33.61 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  32.66 
 
 		 497 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  31.97 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  31.41 
 
 		 517 aa  231  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  36.64 
 
 		 501 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  32.79 
 
 		 461 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  32.99 
 
 		 461 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  32.99 
 
 		 461 aa  229  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  32.99 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  32.79 
 
 		 461 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  32.79 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  32.79 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  32.79 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  32.79 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  32.79 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  32.47 
 
 		 517 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  32.54 
 
 		 510 aa  223  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.33 
 
 		 483 aa  223  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  32.74 
 
 		 510 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  30.94 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  32.03 
 
 		 512 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  32.03 
 
 		 512 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  32.52 
 
 		 461 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  31.86 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  34.12 
 
 		 502 aa  217  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  32.88 
 
 		 499 aa  216  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  35.03 
 
 		 527 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  29.35 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  31.15 
 
 		 463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  33.13 
 
 		 504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  29.13 
 
 		 517 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  29.13 
 
 		 516 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  30.91 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  30.39 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  31.46 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  31.76 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  32.3 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  32.3 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  31.06 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  31.66 
 
 		 449 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  31.66 
 
 		 449 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  31.87 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  31.87 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  28.94 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  33.41 
 
 		 516 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  32 
 
 		 494 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  32.02 
 
 		 534 aa  196  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  31.86 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  29.67 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  27.92 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  29.85 
 
 		 489 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  29.85 
 
 		 489 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  30.71 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  31.26 
 
 		 539 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  31.26 
 
 		 539 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  28.92 
 
 		 489 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  31.26 
 
 		 539 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  29.56 
 
 		 502 aa  186  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  31.72 
 
 		 516 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  29.78 
 
 		 490 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  30.66 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  30.34 
 
 		 489 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  30.12 
 
 		 491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  31.29 
 
 		 539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  28.37 
 
 		 501 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  28.37 
 
 		 501 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  28.37 
 
 		 501 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  28.17 
 
 		 501 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  28.37 
 
 		 501 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  29.84 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>