209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1258 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  100 
 
 		 442 aa  894    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  69.16 
 
 		 460 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  68.83 
 
 		 464 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  68.61 
 
 		 464 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  68.85 
 
 		 460 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  71.66 
 
 		 426 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  72.34 
 
 		 432 aa  623  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  67.96 
 
 		 427 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  36.56 
 
 		 409 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  34.43 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.47 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 412 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.37 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  26.23 
 
 		 412 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.12 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  26.12 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.5 
 
 		 424 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 393 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 393 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 424 aa  97.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.18 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.09 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  21.26 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.62 
 
 		 423 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.96 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.18 
 
 		 423 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.18 
 
 		 423 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.18 
 
 		 423 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.18 
 
 		 423 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 381 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  23.56 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  23.56 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  23.56 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  23.56 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  22.91 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  22.55 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  21.38 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  22.99 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  23.49 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  23.49 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  23.08 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  23.49 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  23.49 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  22.54 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  23.24 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  22.28 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  21.8 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  22.06 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  22.09 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  22.28 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  22.78 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.09 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  22.78 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  22.33 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  22.02 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  22.17 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  22.17 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  22.02 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  22.28 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.09 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.85 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.77 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.51 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  21.95 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  19.86 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2851  transporter, putative  20.63 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  22.71 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  23.19 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  20.9 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  21.73 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  21.78 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0914  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2826  major facilitator transporter  20.79 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>