248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2875 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1331  major facilitator transporter  80.66 
 
 		 513 aa  858    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1505  transporter, putative  81.25 
 
 		 514 aa  856    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0891  major facilitator transporter  83.07 
 
 		 510 aa  864    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3017  major facilitator superfamily MFS_1  81.64 
 
 		 513 aa  866    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227562  normal  0.425104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  100 
 
 		 517 aa  1046    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2748  major facilitator transporter  81.25 
 
 		 514 aa  861    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2826  major facilitator transporter  81.84 
 
 		 514 aa  868    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0914  major facilitator transporter  83.56 
 
 		 511 aa  867    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1000  major facilitator transporter  84.23 
 
 		 510 aa  870    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2924  major facilitator transporter  81.45 
 
 		 514 aa  864    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2851  transporter, putative  81.3 
 
 		 512 aa  856    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1341  major facilitator transporter  81.05 
 
 		 513 aa  863    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0920  major facilitator transporter  83.1 
 
 		 512 aa  879    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.732822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  80.78 
 
 		 513 aa  857    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  82.67 
 
 		 510 aa  864    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2388  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 573 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729986  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2005  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 573 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.685164  hitchhiker  0.0000601576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2104  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 573 aa  153  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2598  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 575 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.823661  normal  0.545914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  36.41 
 
 		 604 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0597  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 475 aa  106  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3854  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  22.76 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  33.1 
 
 		 498 aa  73.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  30.67 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  32.66 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  22.67 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  31.09 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  25.77 
 
 		 479 aa  70.1  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  23.46 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  29.86 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  27.55 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  31.22 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  25.76 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  29.09 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  26.78 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  26.78 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  26.27 
 
 		 461 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  28.25 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  31.71 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  30.14 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  27.92 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.02 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0685  di-/tripeptide transporter  26.32 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.284877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  21.21 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  29.75 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  20.71 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  20.71 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1064  major facilitator superfamily MFS_1  20.71 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.902671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.28 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  26.83 
 
 		 566 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  27.44 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.17 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  26.61 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  21.38 
 
 		 423 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  21.38 
 
 		 423 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  21.38 
 
 		 423 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  21.38 
 
 		 423 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  30.32 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.42 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.21 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  25.93 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50811  POT family transporter: dipeptide/tripeptide:proton  29.38 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  20.87 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  21.94 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3675  Dipeptide/tripeptide permease-like protein  29.89 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  28.67 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  30.82 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  21.89 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  29.6 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  34.67 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  34.67 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  34.67 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  34.67 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  21.45 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  30.67 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  29.27 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  29.27 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  28.97 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  21.31 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  27.55 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  34 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  34 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  20.75 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  24.32 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  34 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  27.72 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>