68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1064 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1064  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 493 aa  996    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.902671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3854  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 469 aa  96.7  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0597  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 475 aa  91.3  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2851  transporter, putative  22.25 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  24.55 
 
 		 604 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 513 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1341  major facilitator transporter  21.63 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0891  major facilitator transporter  21.57 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891594  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2924  major facilitator transporter  20.85 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1505  transporter, putative  21.08 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2748  major facilitator transporter  20.85 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1000  major facilitator transporter  21.36 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2826  major facilitator transporter  20.93 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1331  major facilitator transporter  21.16 
 
 		 513 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0920  major facilitator transporter  20.14 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.732822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3017  major facilitator superfamily MFS_1  20.7 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227562  normal  0.425104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  20.71 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2104  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 573 aa  63.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2005  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.685164  hitchhiker  0.0000601576 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0914  major facilitator transporter  20.81 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2388  major facilitator transporter  21.95 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2598  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.823661  normal  0.545914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  26.15 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  25.9 
 
 		 551 aa  53.9  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  23.38 
 
 		 534 aa  53.5  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  26.63 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  26.63 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  26.63 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  27.68 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  26.19 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  26.63 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  26.63 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  26.63 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  26.19 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  26.63 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  26.19 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  26.19 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  25.6 
 
 		 506 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 506 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  22.8 
 
 		 504 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  24.7 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  25.67 
 
 		 513 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  24.4 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  24.4 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  24.4 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  24.4 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  24.88 
 
 		 584 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  22.22 
 
 		 516 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 527 aa  47.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 516 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  22.92 
 
 		 489 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  22.92 
 
 		 489 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  22.42 
 
 		 446 aa  47.4  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  22.42 
 
 		 446 aa  47.4  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 513 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  22.92 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  20.86 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  24.7 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  23.38 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  20.86 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  20.86 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  20.86 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.6 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  26 
 
 		 499 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.98 
 
 		 501 aa  43.9  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  22.35 
 
 		 502 aa  43.1  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>