277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0759 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  79.88 
 
 		 506 aa  771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  80.49 
 
 		 506 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  97.47 
 
 		 513 aa  947    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  80.2 
 
 		 506 aa  806    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  85.74 
 
 		 507 aa  843    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  78.21 
 
 		 500 aa  758    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  78.21 
 
 		 551 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  78.8 
 
 		 506 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  78.51 
 
 		 551 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  100 
 
 		 513 aa  1034    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  79.88 
 
 		 506 aa  754    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  80.49 
 
 		 507 aa  778    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  79.88 
 
 		 506 aa  754    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  78.21 
 
 		 500 aa  758    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  78.21 
 
 		 500 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  78.21 
 
 		 500 aa  756    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  78.21 
 
 		 500 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  78.21 
 
 		 500 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  59.73 
 
 		 517 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  59.06 
 
 		 517 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  58.83 
 
 		 521 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  59.34 
 
 		 523 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  58.79 
 
 		 546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  58.59 
 
 		 516 aa  601  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  58.28 
 
 		 516 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  58.35 
 
 		 516 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  58.28 
 
 		 516 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  57.6 
 
 		 506 aa  585  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1189  amino acid/peptide transporter  47.61 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.500547 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  41.74 
 
 		 528 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  37.45 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  41.53 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  38.87 
 
 		 501 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  39.07 
 
 		 501 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  39.07 
 
 		 501 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  38.87 
 
 		 501 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  38.87 
 
 		 501 aa  359  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  37.98 
 
 		 506 aa  356  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  38.16 
 
 		 490 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  37.5 
 
 		 489 aa  353  5e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  37.5 
 
 		 489 aa  352  8e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  37.5 
 
 		 489 aa  352  8e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  37.5 
 
 		 489 aa  352  8e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  37.5 
 
 		 489 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  37.7 
 
 		 489 aa  352  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  37.5 
 
 		 489 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  37.5 
 
 		 489 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  37.3 
 
 		 489 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  38.46 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  38.46 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  38.67 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  38.67 
 
 		 500 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  38.67 
 
 		 500 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  38.67 
 
 		 500 aa  350  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  38.67 
 
 		 500 aa  350  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  38.67 
 
 		 500 aa  350  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  38.67 
 
 		 500 aa  349  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  38.43 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  38.16 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  38.16 
 
 		 490 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  38.16 
 
 		 490 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  38.16 
 
 		 490 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  37.32 
 
 		 502 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  38.7 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  38.91 
 
 		 500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  36.54 
 
 		 506 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  37.47 
 
 		 501 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  37.47 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  38.07 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  38.4 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  30.43 
 
 		 516 aa  224  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  29.7 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  29.1 
 
 		 501 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  28.66 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  28.55 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  28.55 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  32.5 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  29.78 
 
 		 489 aa  211  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  30.37 
 
 		 510 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  30.25 
 
 		 527 aa  209  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  29.94 
 
 		 534 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  29.8 
 
 		 492 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 489 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  29.59 
 
 		 492 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  28.52 
 
 		 501 aa  206  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  30.32 
 
 		 491 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  28.19 
 
 		 489 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  28.19 
 
 		 489 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  29 
 
 		 539 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  29.09 
 
 		 539 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  29.06 
 
 		 539 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  29.09 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  28.3 
 
 		 494 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  30.24 
 
 		 490 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  31.85 
 
 		 499 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  29.98 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  29.53 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  31.85 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  30.23 
 
 		 451 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  27.57 
 
 		 544 aa  196  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>