More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1452 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  100 
 
 		 604 aa  1233    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2005  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 573 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.685164  hitchhiker  0.0000601576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2598  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 575 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.823661  normal  0.545914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2388  major facilitator transporter  48.89 
 
 		 573 aa  557  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2104  major facilitator transporter  47.02 
 
 		 573 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 485 aa  180  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0914  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0891  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 510 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0920  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.732822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3017  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227562  normal  0.425104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2826  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2851  transporter, putative  34.87 
 
 		 512 aa  124  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1000  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2924  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 514 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1505  transporter, putative  33.19 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2748  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1341  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1331  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 513 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0597  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3854  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  29.41 
 
 		 566 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  35.33 
 
 		 479 aa  90.1  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  34.81 
 
 		 498 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  25.28 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  29.47 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  26.52 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  28.11 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  27.98 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  24.91 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  30.27 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  34.15 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  31.22 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  25.87 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  29.19 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  31.01 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  27.23 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  25.55 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  30 
 
 		 484 aa  80.1  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  25.55 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  27.81 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  25.48 
 
 		 683 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  30.05 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  25.57 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  25.87 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  25.87 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  25.31 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  25.31 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  25.25 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  33.13 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  24.26 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  31.9 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  29.61 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  25.49 
 
 		 482 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  27.27 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  29.07 
 
 		 506 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  27.27 
 
 		 506 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  29.24 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  28.63 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0685  di-/tripeptide transporter  30.19 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.284877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  28.18 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  28.49 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1064  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.902671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  28.49 
 
 		 507 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  28.49 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  28.65 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  28.65 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  25.51 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  26.97 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  28.49 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  25.77 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  25.77 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  30.18 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  28.71 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  27.78 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  28.49 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  28.49 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  23.25 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  27.81 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  29.94 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  24.73 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  26.89 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  27.23 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  26.78 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  25.9 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1189  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 		 501 aa  73.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.500547 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  28.49 
 
 		 513 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  24.85 
 
 		 527 aa  73.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  28.07 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  25.98 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  26.79 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  26.71 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  26.38 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  26.38 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  29.31 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  26.95 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  25.23 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>