298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0196 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
566 aa  1153    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  33.94 
 
 
462 aa  246  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  32.12 
 
 
516 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  33.89 
 
 
501 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  31.63 
 
 
584 aa  230  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  32.78 
 
 
462 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  31 
 
 
500 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  29.95 
 
 
533 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  31.79 
 
 
501 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  30.21 
 
 
584 aa  221  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  30.71 
 
 
544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  30.48 
 
 
497 aa  210  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  29.76 
 
 
497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  29.8 
 
 
507 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  30.39 
 
 
496 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  26.4 
 
 
507 aa  194  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  29.52 
 
 
495 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  27.37 
 
 
495 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  28.62 
 
 
501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  28.62 
 
 
501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  29.64 
 
 
449 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  29.27 
 
 
449 aa  190  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  29.27 
 
 
449 aa  190  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  28.74 
 
 
506 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  34.89 
 
 
527 aa  186  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  28.8 
 
 
509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  28.46 
 
 
507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  28.12 
 
 
551 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  28.46 
 
 
506 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  28.46 
 
 
506 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  29.19 
 
 
501 aa  183  9.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  29.04 
 
 
513 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  28.12 
 
 
506 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  28.12 
 
 
506 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  27.52 
 
 
551 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  27.52 
 
 
500 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  24.74 
 
 
517 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  27.52 
 
 
500 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  27.87 
 
 
500 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  27.87 
 
 
500 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  27.87 
 
 
500 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  44.34 
 
 
451 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  27.87 
 
 
500 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2082  POT family protein  25.3 
 
 
513 aa  177  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  34.41 
 
 
497 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  28.23 
 
 
483 aa  177  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  26.57 
 
 
498 aa  176  7e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  42.06 
 
 
501 aa  176  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  24.57 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  28.65 
 
 
513 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  28.44 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  34.13 
 
 
498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  28.95 
 
 
395 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  50.49 
 
 
436 aa  174  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  34.41 
 
 
497 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  33.93 
 
 
534 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  27.95 
 
 
546 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  27.64 
 
 
500 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  46.9 
 
 
490 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  34.73 
 
 
539 aa  173  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  34.73 
 
 
539 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  27.46 
 
 
500 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  27.46 
 
 
500 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  27.46 
 
 
500 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  27.46 
 
 
500 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  35.17 
 
 
324 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  44.74 
 
 
489 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  35.47 
 
 
504 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  34.73 
 
 
539 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  27.46 
 
 
517 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  28.88 
 
 
511 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  27.46 
 
 
500 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  27.56 
 
 
516 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  32.63 
 
 
499 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  27.29 
 
 
500 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  44.2 
 
 
491 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  27.29 
 
 
500 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  43.62 
 
 
489 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  27.46 
 
 
517 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  28.7 
 
 
501 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  27.46 
 
 
521 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  28.88 
 
 
488 aa  170  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  27.56 
 
 
516 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  27.56 
 
 
516 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  34.47 
 
 
461 aa  170  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  34.86 
 
 
539 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  27.57 
 
 
502 aa  169  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  40.48 
 
 
501 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  40.48 
 
 
501 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  43.21 
 
 
489 aa  169  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  43.21 
 
 
489 aa  169  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  34.47 
 
 
461 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  27.76 
 
 
516 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  34.47 
 
 
461 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  34.47 
 
 
461 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  34.47 
 
 
461 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  40.48 
 
 
501 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  34.47 
 
 
461 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  42.6 
 
 
444 aa  169  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  34.47 
 
 
461 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>