More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1880 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 501 aa  987    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  65.98 
 
 		 496 aa  644    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.22 
 
 		 495 aa  581  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.35 
 
 		 497 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  50.54 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.26 
 
 		 474 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 475 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.66 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.01 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.21 
 
 		 480 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.87 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.88 
 
 		 474 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.37 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.42 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  34.95 
 
 		 470 aa  226  9e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 474 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.63 
 
 		 522 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.6 
 
 		 461 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 482 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.1 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 		 478 aa  207  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
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NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  35.2 
 
 		 492 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  34.34 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 477 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
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NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.19 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.19 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 512 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.42 
 
 		 482 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.47 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 		 483 aa  196  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.44 
 
 		 483 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 		 505 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 		 540 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 482 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.09 
 
 		 466 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
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NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 498 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 		 486 aa  192  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.66 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 478 aa  189  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 		 539 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.92 
 
 		 539 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 		 487 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.51 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
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NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 487 aa  187  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 534 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 		 498 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.16 
 
 		 558 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.03 
 
 		 520 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 		 478 aa  186  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.01 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 		 528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 		 528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 		 685 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.94 
 
 		 579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 534 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  31.3 
 
 		 465 aa  183  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 		 504 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 		 650 aa  183  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  30.9 
 
 		 458 aa  183  7e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 484 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.62 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  33 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 		 685 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.58 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.53 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.32 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.4 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
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NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.33 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 		 538 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 522 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  32.23 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
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NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 516 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 		 522 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 488 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
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NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  32.18 
 
 		 510 aa  177  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
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NC_008942  Mlab_1287  hypothetical protein  39.13 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.188212 
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 493 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.49 
 
 		 504 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 		 483 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
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