More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4780 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  78.78 
 
 
448 aa  717    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  79.91 
 
 
448 aa  710    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4780  d-galactonate transporter  100 
 
 
444 aa  881    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  78.78 
 
 
448 aa  717    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  50.12 
 
 
474 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  48.01 
 
 
443 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  48.57 
 
 
443 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  46.87 
 
 
442 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.76 
 
 
442 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  44.99 
 
 
445 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 
462 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  46.31 
 
 
454 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  46.89 
 
 
449 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  47.26 
 
 
456 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  46.52 
 
 
450 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  47.26 
 
 
456 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  46.71 
 
 
440 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  47.96 
 
 
459 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4198  major facilitator transporter  47.7 
 
 
459 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0649203  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  46.65 
 
 
434 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  46.65 
 
 
434 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  46.65 
 
 
434 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.17 
 
 
434 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  46.17 
 
 
434 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  46.17 
 
 
434 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.45 
 
 
437 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  46.45 
 
 
449 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 
445 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  43.22 
 
 
437 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  46.65 
 
 
434 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  44.82 
 
 
444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  42.52 
 
 
436 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  42.52 
 
 
436 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  45.32 
 
 
441 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  42.52 
 
 
436 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  42.37 
 
 
451 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 
440 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0341  major facilitator transporter  46.27 
 
 
453 aa  348  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  45.81 
 
 
433 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.35 
 
 
436 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.02 
 
 
439 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  43.65 
 
 
433 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  41.92 
 
 
443 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 
449 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
439 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  41.41 
 
 
441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.12 
 
 
441 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.86 
 
 
469 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.92 
 
 
441 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.86 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.86 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.86 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.86 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.86 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  41.13 
 
 
441 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.38 
 
 
469 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.98 
 
 
444 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  44.98 
 
 
442 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
435 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  43.77 
 
 
439 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  43.22 
 
 
439 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  43.12 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.34 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  43.56 
 
 
441 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.76 
 
 
454 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  43.1 
 
 
441 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.55 
 
 
441 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  43.1 
 
 
441 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  43.1 
 
 
441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  44.74 
 
 
444 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.57 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  41.95 
 
 
440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.38 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.18 
 
 
432 aa  337  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.76 
 
 
440 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.33 
 
 
441 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  43.53 
 
 
446 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  42.86 
 
 
441 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  42.86 
 
 
441 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  41.95 
 
 
442 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  41.93 
 
 
452 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1327  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
435 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  40.9 
 
 
428 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2978  major facilitator transporter  44.76 
 
 
435 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3103  major facilitator transporter  44.76 
 
 
435 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  42.2 
 
 
442 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3213  major facilitator transporter  44.12 
 
 
449 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529349  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  42.62 
 
 
441 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  41.94 
 
 
433 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 
441 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  40.66 
 
 
428 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  41.01 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  41.53 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1058  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  41.94 
 
 
443 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194513  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 
432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 
441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.29 
 
 
442 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  43.9 
 
 
435 aa  326  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  41.22 
 
 
442 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>