More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5121 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  89.34 
 
 		 469 aa  762    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  89.34 
 
 		 440 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  74.35 
 
 		 454 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  89.34 
 
 		 440 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  97.96 
 
 		 441 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  75.35 
 
 		 440 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  90.28 
 
 		 469 aa  769    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  889    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  95.01 
 
 		 441 aa  811    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  76.52 
 
 		 443 aa  688    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  70.86 
 
 		 452 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  99.77 
 
 		 441 aa  888    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  89.34 
 
 		 440 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  81.39 
 
 		 445 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  89.34 
 
 		 440 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  97.28 
 
 		 441 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  96.83 
 
 		 441 aa  844    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  89.34 
 
 		 440 aa  761    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  82.74 
 
 		 445 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  889    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  68.25 
 
 		 437 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  73.05 
 
 		 441 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  73.05 
 
 		 441 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  69.93 
 
 		 440 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  64.27 
 
 		 434 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  68.95 
 
 		 437 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  65.48 
 
 		 433 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  65.48 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  58.28 
 
 		 437 aa  521  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  60.38 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  59.4 
 
 		 442 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  58.81 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  55.84 
 
 		 443 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  58.84 
 
 		 444 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  57.47 
 
 		 434 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  58.33 
 
 		 434 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.15 
 
 		 439 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  57.24 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  57.24 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  56.15 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  57.24 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  56.34 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  57.28 
 
 		 442 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  58.11 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  59.29 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  55.92 
 
 		 439 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  55.23 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  56.55 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  57.24 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  59.62 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  54.44 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  54.44 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  54.21 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 441 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  56.22 
 
 		 441 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 437 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  56.22 
 
 		 441 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  53.85 
 
 		 441 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  54.69 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  57.47 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  55.74 
 
 		 441 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  56.32 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  57.47 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  57.47 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  57.47 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  57.47 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  57.47 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  57.47 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  53.4 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  50.35 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  48.98 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  48.75 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  48.75 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  50.35 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  48.78 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  47.63 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  47.54 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4554  major facilitator transporter  48.85 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  50.82 
 
 		 442 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  50.59 
 
 		 436 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  49.16 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  48.26 
 
 		 455 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  48.92 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 488 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  48.27 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 432 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  49.31 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  49.07 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  49.76 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  48.8 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  46.58 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>