More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4536 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  100 
 
 
443 aa  901    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  63.9 
 
 
477 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  58.96 
 
 
440 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  58.96 
 
 
469 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  58.96 
 
 
440 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  58.96 
 
 
440 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  58.96 
 
 
440 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  58.96 
 
 
440 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  58.29 
 
 
437 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  58.27 
 
 
441 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  58.51 
 
 
441 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  56.29 
 
 
441 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  58.56 
 
 
436 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  58.03 
 
 
441 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  55.66 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  57.79 
 
 
441 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  58.17 
 
 
445 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  57.79 
 
 
441 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  57.79 
 
 
441 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  58.39 
 
 
442 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  56.6 
 
 
469 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  54.1 
 
 
452 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  52.45 
 
 
437 aa  481  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  54.88 
 
 
442 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  58.24 
 
 
444 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  58.24 
 
 
444 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  56.37 
 
 
440 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  51.36 
 
 
451 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  56.88 
 
 
445 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  56.21 
 
 
441 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  56.21 
 
 
441 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  54.9 
 
 
441 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  54.63 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  55.97 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  54.4 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  53.44 
 
 
454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  53.9 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  55.04 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  54.44 
 
 
441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  55.04 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  52.18 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  54.48 
 
 
440 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  51.03 
 
 
439 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  54.27 
 
 
434 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  53.17 
 
 
442 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  54.27 
 
 
434 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  54.5 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  52.96 
 
 
437 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  55.56 
 
 
437 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.8 
 
 
439 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  54.27 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  54.27 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  52.44 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  54.27 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  52.17 
 
 
436 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  52.17 
 
 
436 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  52.17 
 
 
436 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  54.86 
 
 
433 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  54.27 
 
 
434 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  52.8 
 
 
435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  50.47 
 
 
434 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  54.15 
 
 
444 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  53.12 
 
 
435 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  53.12 
 
 
435 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  53.12 
 
 
435 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  53.35 
 
 
435 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  53.12 
 
 
435 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  53.12 
 
 
435 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  53.35 
 
 
435 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  48.08 
 
 
445 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  47.33 
 
 
440 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  47.2 
 
 
443 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  47.33 
 
 
442 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  46.88 
 
 
435 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  46.88 
 
 
435 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  46.88 
 
 
435 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  47.79 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  47.1 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  44.63 
 
 
441 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  50.24 
 
 
439 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  50.24 
 
 
441 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  44.63 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  48.08 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  46.17 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  46.08 
 
 
437 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  46.99 
 
 
455 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  44.9 
 
 
449 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  45.87 
 
 
437 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  46.21 
 
 
436 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  47.44 
 
 
452 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  44.79 
 
 
435 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4554  major facilitator transporter  46.9 
 
 
435 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  47.84 
 
 
444 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  47.18 
 
 
437 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  45.64 
 
 
437 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  45.25 
 
 
488 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 
440 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.04 
 
 
432 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  47.49 
 
 
455 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 
432 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>