More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1903 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  100 
 
 
436 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  100 
 
 
436 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  99.77 
 
 
436 aa  882    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  59.26 
 
 
437 aa  542  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  58.94 
 
 
437 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  60.29 
 
 
436 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  61.58 
 
 
444 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  60.86 
 
 
444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  60.14 
 
 
442 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  58.43 
 
 
434 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  57.97 
 
 
434 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  58.43 
 
 
434 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  58.43 
 
 
434 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  57.97 
 
 
434 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  58.43 
 
 
434 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  58.66 
 
 
434 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  55.35 
 
 
441 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  54.69 
 
 
443 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  54.67 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  53.56 
 
 
437 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  56.57 
 
 
441 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  56.5 
 
 
441 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  52.98 
 
 
451 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  56.44 
 
 
439 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  59.09 
 
 
435 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.21 
 
 
439 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  55.58 
 
 
452 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  55.32 
 
 
440 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  55.79 
 
 
469 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  54.78 
 
 
454 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  55.79 
 
 
440 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  55.79 
 
 
440 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  56.03 
 
 
441 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  55.79 
 
 
440 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  55.79 
 
 
440 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  56.03 
 
 
441 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  56.03 
 
 
441 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  55.79 
 
 
440 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  54.61 
 
 
445 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  54.33 
 
 
439 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  52.17 
 
 
443 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  55.08 
 
 
469 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  55.24 
 
 
433 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  53.51 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  58.61 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  58.61 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  53.33 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  58.61 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  53.92 
 
 
434 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  58.37 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  58.61 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  53.65 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  53.06 
 
 
441 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  53.33 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  58.61 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  58.61 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  53.44 
 
 
445 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  52.14 
 
 
442 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  53.99 
 
 
477 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  52.62 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  51.15 
 
 
441 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  52.2 
 
 
441 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  52.2 
 
 
441 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  50.95 
 
 
442 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  52.2 
 
 
441 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  50.92 
 
 
441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  52.05 
 
 
437 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  50.23 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  54.61 
 
 
437 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  49.43 
 
 
455 aa  437  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
441 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  48.48 
 
 
441 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  49.08 
 
 
462 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  48.69 
 
 
435 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  51.54 
 
 
452 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  51.94 
 
 
456 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  48.15 
 
 
455 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  46.77 
 
 
435 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  46.54 
 
 
435 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  52.05 
 
 
433 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  46.54 
 
 
435 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  48.12 
 
 
437 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  49.04 
 
 
437 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4554  major facilitator transporter  48.16 
 
 
435 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  49.04 
 
 
488 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  47.95 
 
 
444 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  49.64 
 
 
441 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  47.93 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  48.25 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  48.8 
 
 
437 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  49.29 
 
 
448 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  49.29 
 
 
448 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  49.29 
 
 
448 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  46.76 
 
 
445 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  48.18 
 
 
442 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  48.18 
 
 
442 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  48.05 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  46.26 
 
 
449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  48.22 
 
 
441 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>