More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5076 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  100 
 
 
477 aa  960    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  63.9 
 
 
443 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  59.91 
 
 
443 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  59.01 
 
 
441 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  55.94 
 
 
437 aa  521  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  59.95 
 
 
441 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  57.88 
 
 
441 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  60.19 
 
 
441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  60.19 
 
 
441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  59.71 
 
 
441 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  60.19 
 
 
441 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  57.34 
 
 
440 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  59.23 
 
 
444 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  59.57 
 
 
469 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  59.57 
 
 
440 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  59.23 
 
 
444 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  59.57 
 
 
440 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  59.57 
 
 
440 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  59.57 
 
 
440 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  59.57 
 
 
440 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  58.92 
 
 
442 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  56.57 
 
 
454 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  58.56 
 
 
445 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  57.8 
 
 
452 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  60.1 
 
 
436 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  55.63 
 
 
442 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  58.31 
 
 
437 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  57.11 
 
 
437 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  58.37 
 
 
469 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  58.65 
 
 
445 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  58.97 
 
 
433 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  56.92 
 
 
440 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  58.74 
 
 
433 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  57.08 
 
 
437 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  57.37 
 
 
439 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  55.01 
 
 
451 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  56.29 
 
 
434 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  55.3 
 
 
439 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  58.73 
 
 
441 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.53 
 
 
439 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  56.06 
 
 
434 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  58.73 
 
 
441 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  56.06 
 
 
434 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  52.62 
 
 
442 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  56.06 
 
 
434 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  55.58 
 
 
434 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  54.33 
 
 
434 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  55.11 
 
 
441 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  55.58 
 
 
434 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  55.11 
 
 
441 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  54.39 
 
 
441 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  53.15 
 
 
442 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  52.86 
 
 
436 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  52.86 
 
 
436 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  54.63 
 
 
441 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  54.87 
 
 
441 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  52.86 
 
 
436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  55.45 
 
 
435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  55.24 
 
 
433 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  56.02 
 
 
433 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  55.82 
 
 
434 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  56.19 
 
 
435 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  56.93 
 
 
444 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  56.19 
 
 
435 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  55.96 
 
 
435 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  56.19 
 
 
435 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  56.19 
 
 
435 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  56.19 
 
 
435 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  56.19 
 
 
435 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  50.12 
 
 
462 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  49.2 
 
 
437 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  49.2 
 
 
437 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  49.43 
 
 
437 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  47.4 
 
 
488 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  48.62 
 
 
435 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  48.62 
 
 
435 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  47.9 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  48.39 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  48.62 
 
 
443 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4554  major facilitator transporter  49.77 
 
 
435 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  49.07 
 
 
452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  48.48 
 
 
449 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  48.83 
 
 
437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  48.74 
 
 
445 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  49.05 
 
 
455 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  49.41 
 
 
441 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  46.71 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  49.08 
 
 
439 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  47.9 
 
 
436 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  48.8 
 
 
456 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  46.71 
 
 
442 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  46.97 
 
 
441 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 
432 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  48.34 
 
 
441 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 
440 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  46.48 
 
 
444 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  46.24 
 
 
442 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  46.86 
 
 
442 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  46.05 
 
 
455 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>