More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3789 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5122  major facilitator transporter  82.9 
 
 		 428 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  848    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  74.77 
 
 		 442 aa  634    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  99.07 
 
 		 428 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  70.55 
 
 		 429 aa  584  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3379  major facilitator transporter  63.72 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  58.17 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  52.22 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1327  major facilitator family transporter  52.22 
 
 		 435 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2978  major facilitator transporter  52.22 
 
 		 435 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3103  major facilitator transporter  51.99 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172145  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  45.65 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.9 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 440 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  42.89 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 443 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  46.85 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  44.82 
 
 		 434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 459 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  42.38 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.36 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  46.29 
 
 		 449 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 450 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4198  major facilitator transporter  46.58 
 
 		 459 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0649203  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 441 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 434 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.79 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 441 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  46.58 
 
 		 449 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 442 aa  349  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 437 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  43.59 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 441 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  43.49 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 441 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 440 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 440 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  43.37 
 
 		 440 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.37 
 
 		 440 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  43.37 
 
 		 440 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 439 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  43.24 
 
 		 469 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 437 aa  345  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  42.38 
 
 		 437 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 437 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 434 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 437 aa  342  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 448 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 454 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 474 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 448 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 448 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 441 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 435 aa  338  9e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  45.48 
 
 		 455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 462 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 437 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  44.83 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1965  major facilitator transporter  45.9 
 
 		 459 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.683879  normal  0.501277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>