More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4532 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  904    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  48 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  48.58 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  47 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  45.95 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  43.82 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.37 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  45.26 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  45.37 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  45.37 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  45.37 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  45.37 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.21 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  45.29 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.96 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.42 
 
 		 439 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  42.76 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  44.42 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  42.76 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4780  d-galactonate transporter  46.31 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0341  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  46.01 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  46.01 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  47.59 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  47.61 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4198  major facilitator transporter  46.97 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0649203  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.94 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  45.77 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  45.15 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1965  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.683879  normal  0.501277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  44.98 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 		 445 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 443 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 454 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 		 440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 437 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  44.37 
 
 		 437 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 433 aa  362  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5460  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 439 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 437 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 443 aa  359  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 441 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 488 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  43.48 
 
 		 441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>