More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2785 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  100 
 
 		 448 aa  894    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  84.34 
 
 		 448 aa  746    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  100 
 
 		 448 aa  894    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4780  d-galactonate transporter  78.78 
 
 		 444 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 474 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  48.12 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 443 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.09 
 
 		 442 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 440 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 454 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4198  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0649203  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.98 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.98 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.98 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 434 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 441 aa  353  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 449 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 436 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 436 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  44.53 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 436 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 434 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.79 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0341  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 		 440 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.48 
 
 		 469 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.48 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.48 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.48 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.48 
 
 		 469 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.48 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.48 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  40.83 
 
 		 451 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 		 444 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  41.25 
 
 		 441 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 439 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 441 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  40.47 
 
 		 440 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 433 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 440 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 441 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 441 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 441 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 442 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.69 
 
 		 442 aa  332  9e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  43.41 
 
 		 435 aa  328  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 454 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  40.52 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 441 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  43.17 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1058  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  42.32 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3213  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 441 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  41.36 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 440 aa  319  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 		 430 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>