More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5400 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  89.07 
 
 		 444 aa  714    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 430 aa  830    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  89.53 
 
 		 444 aa  718    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  55.63 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.88 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  51.63 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  53.18 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  56.09 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  53.27 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  53.56 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  53.61 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  52.04 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  50.47 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  51.41 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  53.55 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  55.24 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  56.05 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  53.33 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  53.24 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  51.68 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  52.88 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  48.92 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  53.16 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  52.47 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  46.85 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  48.86 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  50.64 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  52 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  48.16 
 
 		 437 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 462 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 434 aa  362  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  48.5 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  48.56 
 
 		 454 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  48.56 
 
 		 454 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  47.55 
 
 		 451 aa  358  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 448 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  49.26 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  47.3 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  43.68 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  47.3 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  48.98 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  47.3 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  48.67 
 
 		 456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  52.2 
 
 		 431 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 437 aa  355  8.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  45.87 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  48.42 
 
 		 444 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 434 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 434 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  46.47 
 
 		 441 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 434 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 434 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  48.54 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  48.29 
 
 		 439 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 434 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  52.13 
 
 		 431 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 441 aa  352  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  44.7 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  45.5 
 
 		 469 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  45.5 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  45.5 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  45.5 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.5 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  45.5 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 441 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 441 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  48.19 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  47.2 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  45.01 
 
 		 469 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>