More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0497 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  96.82 
 
 		 440 aa  830    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  78.16 
 
 		 441 aa  648    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 440 aa  873    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  75.75 
 
 		 439 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5345  major facilitator superfamily MFS_1  72.88 
 
 		 441 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5038  major facilitator transporter  71.43 
 
 		 438 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178058  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  53.94 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5460  major facilitator superfamily MFS_1  51.5 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5847  major facilitator transporter  55.33 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.677532  hitchhiker  0.000346248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  53.53 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 445 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  52.04 
 
 		 439 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  53.88 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  52.88 
 
 		 434 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 		 444 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  53.13 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  49.28 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  52.3 
 
 		 444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  51.42 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  48.16 
 
 		 441 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  48.16 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  48.89 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  54.21 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  47.82 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  47.61 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 		 440 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  50.61 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  47.61 
 
 		 440 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.61 
 
 		 440 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  47.61 
 
 		 440 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  47.61 
 
 		 440 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  47.77 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  47.61 
 
 		 440 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  45.95 
 
 		 451 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  44.54 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  48.38 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  50.64 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 435 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  47.26 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  47.42 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  51.09 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  51.09 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  51.09 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  50.85 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  51.09 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  51.09 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  51.09 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  45.84 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  45.03 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  43.79 
 
 		 444 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  46.7 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  48.77 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  43.69 
 
 		 442 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  45.48 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.12 
 
 		 442 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0341  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  45.61 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  47.72 
 
 		 432 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 454 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  47.1 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>