More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4141 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  84.62 
 
 
441 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  79.28 
 
 
444 aa  705    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  100 
 
 
441 aa  863    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  61.87 
 
 
459 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  59.59 
 
 
454 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  58.43 
 
 
454 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  59.59 
 
 
454 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  62.38 
 
 
474 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  62.11 
 
 
459 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  62.11 
 
 
459 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  61.87 
 
 
459 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  47.43 
 
 
442 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.28 
 
 
432 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  50.47 
 
 
444 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  48 
 
 
432 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
430 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  50.24 
 
 
444 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  50.23 
 
 
440 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  49.16 
 
 
432 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  45 
 
 
437 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.64 
 
 
433 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  44.93 
 
 
443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
432 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  49.88 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 
424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  45.41 
 
 
432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  44.08 
 
 
440 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  45.23 
 
 
444 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  48.67 
 
 
441 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  48.67 
 
 
441 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  46.06 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.52 
 
 
454 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  50.35 
 
 
436 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  47.96 
 
 
435 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  41.96 
 
 
452 aa  349  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  44.94 
 
 
428 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  51.3 
 
 
436 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  42.86 
 
 
440 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  46.1 
 
 
439 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  46.88 
 
 
426 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  42.86 
 
 
440 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  50.82 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  43.52 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  42.39 
 
 
440 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  46.98 
 
 
439 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.11 
 
 
442 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  48.03 
 
 
443 aa  342  9e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  46.46 
 
 
436 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  46.02 
 
 
436 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  45.78 
 
 
436 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  46.02 
 
 
436 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
440 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  45.78 
 
 
444 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  41.52 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  42.79 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  43.78 
 
 
437 aa  340  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  50 
 
 
437 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.8 
 
 
441 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.45 
 
 
441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  43.43 
 
 
433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.8 
 
 
441 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  43.32 
 
 
434 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  42.03 
 
 
441 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  42.03 
 
 
441 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  50.12 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  43.09 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  42.37 
 
 
451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  50.7 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  50.7 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  50.7 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  42.03 
 
 
441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  43.55 
 
 
434 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  43.55 
 
 
434 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  43.55 
 
 
434 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 
441 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.86 
 
 
434 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 
441 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  43.43 
 
 
453 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.6 
 
 
440 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  43.6 
 
 
469 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  43.6 
 
 
440 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  43.6 
 
 
440 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  43.6 
 
 
440 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.22 
 
 
441 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  43.6 
 
 
440 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  44.34 
 
 
450 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.99 
 
 
440 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  50.84 
 
 
431 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  43.35 
 
 
441 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.13 
 
 
437 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  47.89 
 
 
436 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  45.37 
 
 
435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  45.37 
 
 
435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  46.57 
 
 
441 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.86 
 
 
469 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  43.35 
 
 
441 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.52 
 
 
442 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.26 
 
 
439 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 
449 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>