More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1965 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1965  major facilitator transporter  100 
 
 
459 aa  906    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.683879  normal  0.501277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  47.07 
 
 
445 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3029  major facilitator transporter  48.71 
 
 
448 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82994  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  50.51 
 
 
450 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  50.89 
 
 
459 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  50.26 
 
 
449 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4198  major facilitator transporter  51.01 
 
 
459 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0649203  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  50 
 
 
456 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  50 
 
 
456 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.33 
 
 
442 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  47.38 
 
 
443 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  48.98 
 
 
440 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  49.37 
 
 
449 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0341  major facilitator transporter  48.88 
 
 
453 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  45.91 
 
 
442 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  46.5 
 
 
454 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  45.83 
 
 
443 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  45.41 
 
 
441 aa  347  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 
443 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 
440 aa  343  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  46.68 
 
 
441 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  48.21 
 
 
441 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  44.21 
 
 
446 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1058  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  45.28 
 
 
443 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194513  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  48.21 
 
 
441 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  48.21 
 
 
441 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  46.44 
 
 
441 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  44.26 
 
 
428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  44.5 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.06 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  43.36 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  44.93 
 
 
439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.13 
 
 
441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.89 
 
 
469 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  46.41 
 
 
433 aa  335  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.89 
 
 
440 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.89 
 
 
440 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.89 
 
 
440 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.89 
 
 
440 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.89 
 
 
440 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.63 
 
 
437 aa  335  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 
444 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.89 
 
 
441 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.89 
 
 
441 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.73 
 
 
437 aa  333  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.1 
 
 
436 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.65 
 
 
441 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.17 
 
 
441 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.47 
 
 
434 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.47 
 
 
434 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.47 
 
 
434 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.41 
 
 
441 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.47 
 
 
434 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.41 
 
 
441 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.93 
 
 
469 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 
444 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  43.98 
 
 
434 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  44.5 
 
 
451 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  45.95 
 
 
462 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5460  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 
450 aa  329  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  43.73 
 
 
434 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  43.2 
 
 
448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  44.47 
 
 
442 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  45.81 
 
 
435 aa  326  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.96 
 
 
439 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  44.16 
 
 
442 aa  326  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 
449 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  45.36 
 
 
442 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 
440 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 
439 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  39.78 
 
 
448 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  39.78 
 
 
448 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 
429 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  41.99 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  43.73 
 
 
434 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.34 
 
 
434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  41.55 
 
 
474 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  42.31 
 
 
447 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4780  d-galactonate transporter  41.63 
 
 
444 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  43.58 
 
 
445 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  45.01 
 
 
477 aa  316  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.58 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6303  major facilitator transporter  44.12 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  43.13 
 
 
433 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  40.88 
 
 
462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3213  major facilitator transporter  44.26 
 
 
449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529349  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 
445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5345  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12669  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  40.72 
 
 
433 aa  313  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25970  Major facilitator superfamily protein  42.86 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.55 
 
 
443 aa  312  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  40.48 
 
 
433 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1709  major facilitator transporter  46.87 
 
 
446 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5847  major facilitator transporter  44.94 
 
 
455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.677532  hitchhiker  0.000346248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  44.1 
 
 
433 aa  310  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0886  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 
444 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  44.26 
 
 
435 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 
440 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>