More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1709 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4301  major facilitator transporter  89.21 
 
 
451 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0937604  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1709  major facilitator transporter  100 
 
 
446 aa  875    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3213  major facilitator transporter  92.91 
 
 
449 aa  719    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529349  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.04 
 
 
442 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  62.56 
 
 
442 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  66.19 
 
 
449 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  65.47 
 
 
450 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  65.46 
 
 
449 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  65.47 
 
 
456 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  65.47 
 
 
456 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  65.76 
 
 
459 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4198  major facilitator transporter  65.01 
 
 
459 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0649203  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  63.47 
 
 
440 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0341  major facilitator transporter  63.9 
 
 
453 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  43.96 
 
 
445 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 
445 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  45.52 
 
 
437 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4964  d-galactonate transporter  43.62 
 
 
448 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169087  normal  0.027359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2785  d-galactonate transporter  43.62 
 
 
448 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.0710234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  45.15 
 
 
454 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4780  d-galactonate transporter  44.06 
 
 
444 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  42.66 
 
 
446 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  45.41 
 
 
428 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  44.69 
 
 
428 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4811  d-galactonate transporter  43.75 
 
 
448 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00271172  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.24 
 
 
437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.7 
 
 
440 aa  352  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.59 
 
 
443 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 
439 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.53 
 
 
434 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1965  major facilitator transporter  47.13 
 
 
459 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.683879  normal  0.501277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.04 
 
 
434 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.53 
 
 
434 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.03 
 
 
442 aa  349  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.24 
 
 
439 aa  349  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.53 
 
 
434 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.53 
 
 
434 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.53 
 
 
434 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  42.15 
 
 
474 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  42.82 
 
 
443 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  42.44 
 
 
439 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 
462 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  45.23 
 
 
433 aa  346  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  43.52 
 
 
441 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  41.76 
 
 
441 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  43.34 
 
 
469 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.53 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  45.01 
 
 
434 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.24 
 
 
443 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  43.34 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  43.34 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  43.34 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  43.34 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.34 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 
429 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  43.28 
 
 
439 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.3 
 
 
436 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  41.89 
 
 
441 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
440 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.3 
 
 
437 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.73 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1058  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  41.86 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194513  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.65 
 
 
441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.65 
 
 
441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.51 
 
 
443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  43.29 
 
 
432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.37 
 
 
469 aa  335  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 
440 aa  335  9e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  40.79 
 
 
441 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.4 
 
 
441 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  41.47 
 
 
440 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  41.38 
 
 
445 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5122  major facilitator transporter  44.92 
 
 
428 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6711  major facilitator transporter  43.49 
 
 
442 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6476  major facilitator transporter  43.49 
 
 
442 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  41.92 
 
 
442 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3029  major facilitator transporter  45.12 
 
 
448 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82994  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  43.45 
 
 
440 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  41.51 
 
 
442 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.19 
 
 
434 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 
432 aa  329  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  38.44 
 
 
436 aa  329  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  38.44 
 
 
436 aa  329  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.09 
 
 
454 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  43.27 
 
 
435 aa  329  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  38.44 
 
 
436 aa  328  9e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  41.07 
 
 
433 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  40.93 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  43.06 
 
 
437 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  44.39 
 
 
442 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3379  major facilitator transporter  46.45 
 
 
434 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
443 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
441 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  41.3 
 
 
442 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  40.62 
 
 
462 aa  323  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  41.55 
 
 
432 aa  322  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  41.46 
 
 
435 aa  322  9.000000000000001e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>