More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6697 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  100 
 
 
442 aa  883    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  74.77 
 
 
428 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  74.07 
 
 
428 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  74.02 
 
 
429 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5122  major facilitator transporter  74.47 
 
 
428 aa  591  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3379  major facilitator transporter  62.44 
 
 
434 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  55.16 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  52.55 
 
 
435 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  48.99 
 
 
445 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1327  major facilitator family transporter  53.04 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3103  major facilitator transporter  52.55 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172145  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2978  major facilitator transporter  53.04 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.583372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  47.99 
 
 
437 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  48.89 
 
 
442 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 
440 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 
444 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 
462 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  48 
 
 
437 aa  358  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  45.83 
 
 
442 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.45 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.7 
 
 
439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  44.05 
 
 
442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.7 
 
 
439 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  45.91 
 
 
454 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  46.29 
 
 
439 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  45.7 
 
 
443 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  43.98 
 
 
451 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  45.67 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.46 
 
 
434 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  46.46 
 
 
434 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.7 
 
 
436 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  46.02 
 
 
441 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  44.58 
 
 
441 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  45.3 
 
 
434 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  47.17 
 
 
434 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  44.11 
 
 
441 aa  349  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  45.59 
 
 
442 aa  349  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  42.45 
 
 
462 aa  348  8e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  45.21 
 
 
441 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  45.21 
 
 
441 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.56 
 
 
441 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  45.21 
 
 
441 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  46.68 
 
 
434 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  44.34 
 
 
441 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  46.68 
 
 
434 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  46.68 
 
 
434 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  45.21 
 
 
441 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  43.15 
 
 
443 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  45.23 
 
 
433 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  45.78 
 
 
441 aa  346  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  44.23 
 
 
452 aa  345  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  45.45 
 
 
469 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  44.74 
 
 
449 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  43.75 
 
 
437 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  43.09 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
437 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.45 
 
 
440 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  45.45 
 
 
440 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  45.45 
 
 
440 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  45.45 
 
 
440 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  43.56 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  45.45 
 
 
440 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  43.56 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  44.31 
 
 
488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  44.88 
 
 
445 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  44.62 
 
 
450 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  44.17 
 
 
437 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4302  major facilitator transporter  44.53 
 
 
449 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392665  normal  0.708279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  44.96 
 
 
469 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  42.76 
 
 
449 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  43.33 
 
 
441 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 
440 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  42.33 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  42.92 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  42.92 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  43.03 
 
 
454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  44.05 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.23 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  43.77 
 
 
459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  42.86 
 
 
441 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  47.17 
 
 
434 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4198  major facilitator transporter  43.51 
 
 
459 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0649203  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1636  MFS transporter  42.33 
 
 
441 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  45.74 
 
 
435 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0172  major facilitator family transporter  42.33 
 
 
441 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0261  major facilitator superfamily permease  42.09 
 
 
441 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.21 
 
 
436 aa  332  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.21 
 
 
436 aa  332  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  42.59 
 
 
447 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  43.1 
 
 
436 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  46.74 
 
 
443 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4048  major facilitator transporter  41.13 
 
 
442 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707986  normal  0.777424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  41.53 
 
 
446 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4220  major facilitator transporter  42.32 
 
 
440 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  42.55 
 
 
437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  43.1 
 
 
437 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  42.65 
 
 
435 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 
443 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  41.23 
 
 
474 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>