More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0200 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0261  major facilitator superfamily permease  94.56 
 
 
441 aa  773    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1636  MFS transporter  94.78 
 
 
441 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  100 
 
 
441 aa  866    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0172  major facilitator family transporter  94.78 
 
 
441 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  58.39 
 
 
441 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  57.86 
 
 
441 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  60.91 
 
 
443 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  60 
 
 
436 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  61.03 
 
 
455 aa  501  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  59 
 
 
440 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  59.45 
 
 
442 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  59 
 
 
442 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  58.8 
 
 
442 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1381  major facilitator superfamily MFS_1  59.17 
 
 
438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  48.72 
 
 
437 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  51.01 
 
 
444 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  51.71 
 
 
444 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  52.13 
 
 
437 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  51.04 
 
 
440 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  52.13 
 
 
442 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  52.63 
 
 
436 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  47.84 
 
 
437 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  52.84 
 
 
434 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  48.53 
 
 
451 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  51.9 
 
 
434 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  52.61 
 
 
434 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  52.13 
 
 
434 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  52.13 
 
 
434 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  52.13 
 
 
434 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  49.43 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  47.47 
 
 
454 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.31 
 
 
439 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  49.08 
 
 
439 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  48.12 
 
 
452 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  52.13 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  49.31 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  49.41 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  48.5 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  48.22 
 
 
436 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  48.22 
 
 
436 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  48.22 
 
 
436 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  52.3 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  46.71 
 
 
440 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  46.71 
 
 
469 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  46.71 
 
 
440 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  48 
 
 
442 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  46.71 
 
 
440 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  45.52 
 
 
441 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  46.71 
 
 
440 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  47.29 
 
 
433 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  49.04 
 
 
437 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  46.71 
 
 
440 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  46 
 
 
445 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  45.82 
 
 
442 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  46.24 
 
 
441 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.92 
 
 
441 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  46.48 
 
 
469 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  45.07 
 
 
441 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  45.54 
 
 
441 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  46.24 
 
 
441 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  45.82 
 
 
462 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  46.21 
 
 
437 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  46.24 
 
 
441 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 
441 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  46.59 
 
 
433 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  52.54 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  52.54 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  52.54 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  46.93 
 
 
445 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  52.78 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  46.59 
 
 
433 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  48.11 
 
 
456 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 
441 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  52.54 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  52.54 
 
 
435 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 
445 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  48.54 
 
 
441 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  47.51 
 
 
442 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  52.54 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  48.34 
 
 
477 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  45.65 
 
 
443 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  49.03 
 
 
441 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  48.3 
 
 
441 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  45.91 
 
 
435 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  49.03 
 
 
441 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  45.91 
 
 
435 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  45.91 
 
 
435 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 
452 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3501  major facilitator transporter  45.88 
 
 
435 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  48.79 
 
 
441 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  47.8 
 
 
444 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  45.5 
 
 
434 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  48.23 
 
 
433 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  52.23 
 
 
443 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  46.25 
 
 
462 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  45.61 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4554  major facilitator transporter  46.06 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  47.26 
 
 
432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  45.5 
 
 
437 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10600  putative MFS transporter  47.65 
 
 
434 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>