More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9121 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  100 
 
 		 432 aa  854    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  75.18 
 
 		 432 aa  617  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  78.07 
 
 		 437 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  72.41 
 
 		 432 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  72.86 
 
 		 432 aa  598  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  69.98 
 
 		 433 aa  594  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  61.83 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  60.46 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  62.95 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  61.27 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  62.95 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  62.74 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  60.92 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  62.95 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  63.9 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  62.71 
 
 		 431 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  56.1 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  55.3 
 
 		 444 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  54.52 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  52.21 
 
 		 430 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  48.98 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  52.93 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  50.9 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  52.87 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  54.63 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  50.59 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  49.03 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  56.77 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  51.24 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  49.16 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  50.35 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  49.05 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  51.35 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  50 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  51.9 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  51.63 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  49.5 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  49.04 
 
 		 443 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  49.5 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  50.63 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  49.52 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  48.51 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  50.51 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 441 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  48.32 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  49.02 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  52.43 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  50.86 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  48.49 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  51.92 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  49.17 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  52.18 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  49.05 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  48.81 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  49.05 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  48.81 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  49.05 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  48.74 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  48.24 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  46.17 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  49.05 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  47.5 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  48.79 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  49.29 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>