More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04694 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  100 
 
 		 453 aa  904    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  77.08 
 
 		 444 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  52.08 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  47.41 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  48.35 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  48.79 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  48.71 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  45.22 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 437 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  47.6 
 
 		 432 aa  352  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 428 aa  350  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  45.37 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 441 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 441 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 459 aa  345  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  44.55 
 
 		 469 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  44.55 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  44.55 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  44.55 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  44.55 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  44.55 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  44.31 
 
 		 469 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 		 441 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  49.2 
 
 		 443 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  45.02 
 
 		 454 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  45.02 
 
 		 454 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  41.49 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  46.1 
 
 		 474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 436 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  42.04 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  45.41 
 
 		 445 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  42.04 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 439 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 444 aa  332  9e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 440 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 440 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 459 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 445 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 459 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  43.4 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 440 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 437 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  40.83 
 
 		 441 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  47.84 
 
 		 436 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 		 441 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 		 441 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 442 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 459 aa  325  7e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 441 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 440 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  45.91 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.28 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  46.9 
 
 		 436 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 434 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  42.02 
 
 		 431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 434 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>