More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2936 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  100 
 
 
435 aa  872    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  69.46 
 
 
433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  62.29 
 
 
441 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  51.31 
 
 
443 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  52.39 
 
 
443 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.87 
 
 
432 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  46.08 
 
 
437 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 
424 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  43.57 
 
 
437 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  47.59 
 
 
436 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  49.24 
 
 
441 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  46.75 
 
 
433 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 
430 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  47.06 
 
 
441 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  46.75 
 
 
432 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  46.71 
 
 
439 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  47.72 
 
 
444 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.31 
 
 
434 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  46.31 
 
 
434 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  46.49 
 
 
443 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  46.31 
 
 
434 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  47.21 
 
 
444 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 
444 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  46.3 
 
 
436 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 
440 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.89 
 
 
433 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  45.45 
 
 
441 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 
444 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  44.18 
 
 
437 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  45.85 
 
 
434 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  45.85 
 
 
434 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  45.85 
 
 
434 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  47.51 
 
 
454 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  48.15 
 
 
432 aa  359  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.58 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  45.59 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.31 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.75 
 
 
444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  45.59 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  45.34 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  45.13 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.59 
 
 
441 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.07 
 
 
439 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  45.34 
 
 
441 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  44.68 
 
 
442 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  44.85 
 
 
469 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  48.9 
 
 
432 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  44.85 
 
 
440 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  44.85 
 
 
440 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  44.85 
 
 
440 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  43.78 
 
 
433 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  44.85 
 
 
440 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  44.85 
 
 
440 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  43.78 
 
 
433 aa  354  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  44.85 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  47.24 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  46.25 
 
 
437 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  45.61 
 
 
444 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  42.49 
 
 
451 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  45.85 
 
 
434 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  44.69 
 
 
440 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  46.71 
 
 
432 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  44.16 
 
 
454 aa  349  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  49.87 
 
 
437 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  42.03 
 
 
442 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
449 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  41.33 
 
 
441 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.49 
 
 
434 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  44.12 
 
 
445 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 
440 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  44.79 
 
 
428 aa  342  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
441 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  46.45 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  42.07 
 
 
445 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 
441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  42.72 
 
 
428 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  42.34 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 
450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 
453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  47.24 
 
 
440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  43.95 
 
 
448 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  43.95 
 
 
448 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  43.95 
 
 
448 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  47.91 
 
 
445 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  42.49 
 
 
428 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  44.25 
 
 
440 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  44.25 
 
 
440 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  40.37 
 
 
443 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  42.37 
 
 
441 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  43.66 
 
 
458 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  46.98 
 
 
435 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  46.98 
 
 
435 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  46.98 
 
 
435 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  46.98 
 
 
435 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  42.89 
 
 
453 aa  332  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.42 
 
 
442 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  50.66 
 
 
433 aa  333  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  46.99 
 
 
435 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  46.99 
 
 
435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  41.82 
 
 
452 aa  332  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>