More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5346 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
444 aa  852    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  97.3 
 
 
444 aa  804    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  89.53 
 
 
430 aa  724    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  56.31 
 
 
432 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  51.29 
 
 
432 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  52.08 
 
 
432 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  53.11 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  54.24 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  54.18 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  52.48 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  52.63 
 
 
432 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  51.83 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 
444 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  52.22 
 
 
450 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  54.31 
 
 
432 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  47.99 
 
 
442 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  54.36 
 
 
437 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  54.29 
 
 
430 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  50.24 
 
 
441 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  48.82 
 
 
454 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  52.99 
 
 
435 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  53.68 
 
 
441 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  48.23 
 
 
445 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  53.68 
 
 
443 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  51.76 
 
 
436 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  55.56 
 
 
433 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  52.24 
 
 
436 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  46.59 
 
 
459 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  48.74 
 
 
424 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
433 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  52.82 
 
 
436 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  50.81 
 
 
436 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  52.58 
 
 
436 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  48.3 
 
 
440 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  48.81 
 
 
454 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  48.81 
 
 
454 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  52.46 
 
 
436 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  52.46 
 
 
436 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  52.46 
 
 
436 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  49.62 
 
 
439 aa  362  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  48 
 
 
474 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  47.41 
 
 
459 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  47.41 
 
 
459 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  47.41 
 
 
459 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  46.47 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  47.23 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  47.96 
 
 
434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  46.97 
 
 
440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  46.73 
 
 
440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  46.97 
 
 
440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  44.69 
 
 
437 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  45.04 
 
 
437 aa  355  8.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  49.26 
 
 
436 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  45.71 
 
 
433 aa  354  2e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  52.13 
 
 
431 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  48.65 
 
 
437 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  47.46 
 
 
459 aa  352  5e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  47.55 
 
 
444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  43.35 
 
 
462 aa  352  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  48.04 
 
 
439 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  47.6 
 
 
440 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  48.33 
 
 
434 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  48.33 
 
 
434 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  51.04 
 
 
431 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  48.33 
 
 
434 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  47.48 
 
 
434 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  43.93 
 
 
448 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  47.44 
 
 
435 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  43.93 
 
 
448 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  43.93 
 
 
448 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  45.74 
 
 
441 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  46.23 
 
 
441 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  47.24 
 
 
434 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  45.83 
 
 
451 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  46.23 
 
 
441 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  47.41 
 
 
441 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  46.23 
 
 
441 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  46.29 
 
 
436 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  49.04 
 
 
434 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  47.74 
 
 
442 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  42.06 
 
 
441 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.74 
 
 
441 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.34 
 
 
442 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  47.41 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 
444 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  46.23 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  45.74 
 
 
441 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  47.26 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  45.91 
 
 
437 aa  343  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  45.74 
 
 
469 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  48.44 
 
 
444 aa  342  7e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  45.74 
 
 
440 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  45.74 
 
 
440 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  45.74 
 
 
440 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  45.74 
 
 
440 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.74 
 
 
440 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  45.63 
 
 
437 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 
439 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>