More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1228 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  80.73 
 
 		 436 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  100 
 
 		 436 aa  859    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  78.9 
 
 		 436 aa  623  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  78.67 
 
 		 436 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  77.98 
 
 		 436 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  78.8 
 
 		 436 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  78.8 
 
 		 436 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  78.8 
 
 		 436 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  71.23 
 
 		 431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  71.46 
 
 		 431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  62.82 
 
 		 432 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  61.27 
 
 		 432 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  58.93 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  59.39 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  57.8 
 
 		 433 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  60.33 
 
 		 437 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  49.54 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  52.75 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  48.5 
 
 		 430 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  51.5 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  47.15 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  50.49 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  48.83 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  49.75 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  46.21 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  48.02 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  47.89 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 444 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 435 aa  358  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  47.84 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 439 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 440 aa  355  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 		 444 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  46.1 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 462 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 		 424 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  46 
 
 		 445 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 452 aa  345  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  45.21 
 
 		 469 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 434 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  45.21 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  45.21 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  45.21 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  45.21 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.21 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.71 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  45.35 
 
 		 430 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.78 
 
 		 444 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.71 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 435 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 441 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 441 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 441 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  40.51 
 
 		 435 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 441 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 434 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  44.05 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.67 
 
 		 444 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  44.05 
 
 		 433 aa  336  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 440 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 440 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 443 aa  335  9e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.9 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.76 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 449 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>