More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4806 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  99.54 
 
 		 435 aa  846    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  96.55 
 
 		 435 aa  796    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  99.54 
 
 		 435 aa  846    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  97.01 
 
 		 435 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8308  major facilitator superfamily MFS_1  60.66 
 
 		 435 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  47.83 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  45.65 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  44.07 
 
 		 432 aa  362  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  49.14 
 
 		 439 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  44.92 
 
 		 433 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 		 430 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 440 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  45.3 
 
 		 444 aa  346  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 		 432 aa  346  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  47.53 
 
 		 444 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  44.69 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 454 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 441 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 428 aa  342  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  43.24 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 459 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  45.41 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  47.74 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 474 aa  326  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 434 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 434 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 434 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  47.02 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 436 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 436 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  41 
 
 		 440 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  41 
 
 		 440 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 		 444 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 428 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 437 aa  319  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  46.32 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 428 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 428 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 440 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  45.73 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 443 aa  313  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  41.61 
 
 		 435 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  41.36 
 
 		 453 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 		 453 aa  312  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  44.37 
 
 		 431 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 434 aa  312  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 445 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 454 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 433 aa  310  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 462 aa  308  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  40.52 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.58 
 
 		 469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  43.91 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  42.44 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>