More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5619 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  77.49 
 
 		 440 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  870    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  89.88 
 
 		 444 aa  760    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  84.97 
 
 		 439 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  58.04 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  58.04 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  57.58 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  58.67 
 
 		 440 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  58.71 
 
 		 440 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  63.45 
 
 		 441 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  63.45 
 
 		 441 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 440 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  52.3 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  52.41 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  49.88 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  50.23 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  53.48 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  49.66 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  49.41 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  47.87 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  50.62 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  46.46 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  46.05 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 		 450 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  47.17 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 441 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  47.87 
 
 		 444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  43.76 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 436 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  46.87 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 442 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  43.14 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  45.62 
 
 		 436 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 444 aa  326  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  45.03 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  44.34 
 
 		 431 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  42.83 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 437 aa  315  8e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  41.31 
 
 		 443 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 441 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 442 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  40.88 
 
 		 440 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 		 449 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 459 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 441 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.2 
 
 		 469 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 442 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.2 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.2 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.2 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.2 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.2 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  38.69 
 
 		 441 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 436 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  39.59 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.46 
 
 		 469 aa  299  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 		 424 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>