More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4836 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  100 
 
 
452 aa  879    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  78.73 
 
 
439 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  70.66 
 
 
472 aa  571  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  52.3 
 
 
440 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  53.61 
 
 
444 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  53.49 
 
 
439 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  51.52 
 
 
440 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  55.03 
 
 
441 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  55.03 
 
 
441 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  50.11 
 
 
440 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  50.46 
 
 
440 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  49.89 
 
 
440 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  49.89 
 
 
440 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  51.84 
 
 
439 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  53.32 
 
 
440 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  52.28 
 
 
435 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  47.83 
 
 
432 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  47.82 
 
 
432 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  47.91 
 
 
432 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  48.83 
 
 
428 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  46.77 
 
 
432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.5 
 
 
433 aa  352  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  45.05 
 
 
443 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  49.14 
 
 
432 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  48.26 
 
 
430 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  49.25 
 
 
437 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  48.52 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  46.83 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 
444 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  44.22 
 
 
459 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  44.64 
 
 
441 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  47.96 
 
 
430 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  44.65 
 
 
442 aa  333  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 
444 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  45.07 
 
 
435 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  48.45 
 
 
443 aa  329  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  47.19 
 
 
444 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  48.7 
 
 
433 aa  326  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
450 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  44.22 
 
 
474 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.71 
 
 
440 aa  323  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  44.12 
 
 
454 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  43.94 
 
 
433 aa  319  5e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.28 
 
 
439 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 
440 aa  315  9e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  43 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.62 
 
 
441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  43.43 
 
 
459 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  43.43 
 
 
459 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  43.43 
 
 
459 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 
454 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 
454 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  42.92 
 
 
441 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  42.93 
 
 
444 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  42.92 
 
 
441 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.61 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.23 
 
 
441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  44.31 
 
 
441 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  43.57 
 
 
441 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  43.57 
 
 
441 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  43.98 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  41.08 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  44.23 
 
 
469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  43.57 
 
 
441 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.87 
 
 
437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  42.23 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  43.3 
 
 
469 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  43.3 
 
 
440 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  43.3 
 
 
440 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.3 
 
 
440 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  43.3 
 
 
440 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  43.3 
 
 
440 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  42.07 
 
 
442 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.86 
 
 
437 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  42 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  42 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  44.26 
 
 
439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  43.53 
 
 
442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  43.53 
 
 
453 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  46.93 
 
 
436 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  46.54 
 
 
436 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  46.64 
 
 
436 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  41.47 
 
 
454 aa  302  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  46.05 
 
 
436 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 
424 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  46.87 
 
 
436 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  41 
 
 
452 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  46.87 
 
 
436 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  43.84 
 
 
435 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  46.87 
 
 
436 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  43.58 
 
 
436 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  43.84 
 
 
435 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  42.82 
 
 
437 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  44.96 
 
 
436 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  42.61 
 
 
433 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  43.44 
 
 
435 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  43.44 
 
 
435 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  41.47 
 
 
437 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  43.2 
 
 
435 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  42.75 
 
 
434 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>