More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4137 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  86.12 
 
 		 444 aa  733    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  874    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  85.18 
 
 		 439 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  81 
 
 		 440 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  60.38 
 
 		 440 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  59.9 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  59.9 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  59.67 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  58.22 
 
 		 440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  62.85 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  62.85 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  51.93 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  52.46 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  51.17 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  51.88 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  49.88 
 
 		 472 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  49.65 
 
 		 432 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  49.19 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  47.99 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  48.68 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.03 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  51.76 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  47.1 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  47.78 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 444 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 442 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  46.98 
 
 		 431 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  48.01 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  47.29 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  48.08 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  43 
 
 		 437 aa  332  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  46.05 
 
 		 431 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  41.74 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 439 aa  329  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  47.83 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  49.34 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  45.73 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 445 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  42.27 
 
 		 453 aa  318  9e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 459 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 459 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.77 
 
 		 437 aa  312  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 441 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 441 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 435 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 435 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  48.69 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 442 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  41.79 
 
 		 458 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  41.79 
 
 		 458 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  40.19 
 
 		 443 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  41.79 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  41.79 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.99 
 
 		 440 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 469 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 440 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 		 449 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 440 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.99 
 
 		 440 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.99 
 
 		 440 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  44.87 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 441 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  40.18 
 
 		 458 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  41.3 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  40.18 
 
 		 458 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.65 
 
 		 469 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>