More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04224 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  100 
 
 		 458 aa  925    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  88.21 
 
 		 458 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  99.78 
 
 		 458 aa  923    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1641  4-hydroxyphenylacetate permease  76.1 
 
 		 455 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2454  4-hydroxyphenylacetate transporter  76.1 
 
 		 455 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.564928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2358  4-hydroxyphenylacetate permease  76.1 
 
 		 455 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.876442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  87.99 
 
 		 458 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  88.21 
 
 		 458 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  99.78 
 
 		 458 aa  924    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  87.99 
 
 		 458 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  88.21 
 
 		 458 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  925    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0632  4-hydroxyphenylacetate transporter  82.33 
 
 		 456 aa  748    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.862477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4191  4-hydroxyphenylacetate transporter  60.14 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  44.12 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42.07 
 
 		 432 aa  337  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  42.93 
 
 		 432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 440 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  40.05 
 
 		 432 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  41.97 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.49 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 444 aa  323  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.13 
 
 		 439 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 434 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  40.09 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 436 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  42.4 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 439 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  40.32 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 437 aa  308  9e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  39.77 
 
 		 443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 443 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  38.81 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 462 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  38.84 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  37.33 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 436 aa  300  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 436 aa  300  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 445 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 441 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  36.61 
 
 		 433 aa  299  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.6 
 
 		 442 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  36.38 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  38.46 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 452 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 		 430 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 437 aa  295  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1075  major facilitator transporter  39 
 
 		 474 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.561566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  38.22 
 
 		 444 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 437 aa  294  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  41.72 
 
 		 431 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 442 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  36.87 
 
 		 442 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  38.58 
 
 		 435 aa  292  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 442 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  37.35 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  37.35 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>