More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4100 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  81.74 
 
 		 440 aa  729    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  81.67 
 
 		 440 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  880    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  81.44 
 
 		 440 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  80.28 
 
 		 440 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  880    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  81.44 
 
 		 440 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  60.43 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  61.06 
 
 		 444 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  61.3 
 
 		 439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  61.24 
 
 		 439 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  50.34 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  50.92 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  51.31 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.3 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  51.2 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  50.82 
 
 		 472 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  51.9 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.79 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  48.69 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  46.68 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  51.78 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  44.82 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.95 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  47.52 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 444 aa  353  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  47.68 
 
 		 430 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 		 450 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  46.9 
 
 		 445 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 459 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 439 aa  339  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  49.08 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 444 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 459 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 459 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 459 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  45.94 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  42.29 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.65 
 
 		 440 aa  325  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  46.74 
 
 		 431 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 440 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 441 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 436 aa  318  7.999999999999999e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 426 aa  318  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.58 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  45.02 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 437 aa  315  8e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.23 
 
 		 451 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  41.86 
 
 		 437 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 445 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 445 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  40.42 
 
 		 433 aa  312  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 454 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 436 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 454 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 469 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  40.19 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>