More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2717 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  892    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  57.88 
 
 		 444 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  60.25 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  57.11 
 
 		 441 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  55.8 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  54.52 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  54.52 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  54.73 
 
 		 474 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  54.52 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  54.52 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  54.29 
 
 		 459 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  51.1 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  50.12 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  49.29 
 
 		 432 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  51.64 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  46.95 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  49.11 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  48.02 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  49.88 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  48.09 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  46.3 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  46.3 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  47.39 
 
 		 439 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  45.72 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  48.98 
 
 		 424 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 440 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 440 aa  349  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  50.63 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  47.19 
 
 		 433 aa  345  7e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.31 
 
 		 439 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  46.55 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 		 439 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 434 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 452 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 434 aa  339  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 441 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  44.8 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 440 aa  335  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 436 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 436 aa  335  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 436 aa  335  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  44.25 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 445 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 435 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 435 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 435 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 435 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  43.99 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.99 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  43.99 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  43.75 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  43.99 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  43.99 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  43.99 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  43.27 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  43.03 
 
 		 445 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 445 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  38.62 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  45.07 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 439 aa  324  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>