More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2715 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  79.56 
 
 		 439 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  877    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  80 
 
 		 439 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  80.34 
 
 		 444 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  57.95 
 
 		 440 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  59.24 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  59.24 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  59.24 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 440 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  61.19 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  61.19 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  52.98 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  51.13 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  50.81 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  48.95 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  50.81 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  50.71 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  51.38 
 
 		 452 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  49.07 
 
 		 432 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  48.46 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.98 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  49.19 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  51.25 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 454 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  46.19 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  45.93 
 
 		 430 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 436 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  46.28 
 
 		 431 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 443 aa  329  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  44.77 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 445 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 444 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  41.62 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  41.24 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  41.24 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  41.24 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  41.01 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  41.01 
 
 		 458 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  43.35 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  42.18 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 459 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  43.37 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  39.32 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  45.57 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 435 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  39.86 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  39.86 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  43.13 
 
 		 433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  39.86 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  39.86 
 
 		 458 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 441 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 441 aa  302  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 441 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 441 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.1 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  40.1 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  40.1 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  40.1 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  40.1 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>