More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4099 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 454 aa  901    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  84.04 
 
 		 474 aa  715    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  84.92 
 
 		 459 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  84.92 
 
 		 459 aa  725    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  84.7 
 
 		 459 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  84.99 
 
 		 459 aa  757    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 454 aa  901    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  60.8 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  60.09 
 
 		 441 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  62.3 
 
 		 441 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  54.99 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  50.37 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  48.97 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  46.99 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  49.3 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  49.61 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 		 432 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 442 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 		 441 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 		 441 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.43 
 
 		 433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  45.84 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 435 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 435 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  47.19 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 440 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 440 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 440 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 435 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 440 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 444 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 443 aa  342  9e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  43.56 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 424 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 439 aa  338  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  44.26 
 
 		 450 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 434 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.63 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 441 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 440 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 442 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 		 430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  328  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 436 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 443 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  44.27 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  47.74 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 440 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  45.78 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  48.73 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  45.93 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 		 452 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  43.32 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 441 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 435 aa  322  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 441 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.55 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.55 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>