More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4631 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  100 
 
 		 437 aa  861    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  77.21 
 
 		 432 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  79.12 
 
 		 432 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  74.31 
 
 		 433 aa  628  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  74.01 
 
 		 432 aa  626  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  73.78 
 
 		 432 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  63.51 
 
 		 436 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  60.36 
 
 		 436 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  62.65 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  60.37 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  61.05 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  62.56 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  62.56 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  62.56 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  65.27 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  63.87 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  55.19 
 
 		 432 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  52.34 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  54.52 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  54.68 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  53.49 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  51.84 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  54.01 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  51.5 
 
 		 450 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  53.83 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  49.17 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  49.17 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  48.03 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  50.62 
 
 		 439 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  49.17 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  51.78 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  50.62 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  51.78 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  48.96 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  49.16 
 
 		 437 aa  411  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  52.1 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  52.57 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  49.28 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  50.37 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 435 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  47.54 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  49.75 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  50.47 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  49.28 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  49.03 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  49.03 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 454 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  51.8 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  49.03 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  49.03 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  51.8 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  49.03 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  49.03 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  49.03 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  50 
 
 		 440 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 433 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  46.92 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  49.27 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  46.79 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  46.52 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  48.31 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  50.62 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  52.79 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  48.98 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  46.79 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  52.3 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  48.7 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  51.32 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  50.72 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  50.72 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 452 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 439 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>