More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6799 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  100 
 
 
428 aa  835    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  88.34 
 
 
430 aa  690    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  59.86 
 
 
445 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  59.29 
 
 
450 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  68.53 
 
 
433 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  55.02 
 
 
442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  57.79 
 
 
443 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  51.88 
 
 
432 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  56.88 
 
 
430 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  52.87 
 
 
432 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  52.58 
 
 
432 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  53.73 
 
 
432 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  56.36 
 
 
444 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  55.84 
 
 
444 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  50.48 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  50.5 
 
 
439 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  54.02 
 
 
437 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  51.4 
 
 
435 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 
432 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  52.24 
 
 
440 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  46.86 
 
 
437 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
439 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  49.01 
 
 
459 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  49.52 
 
 
435 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  48.01 
 
 
440 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  45.12 
 
 
435 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  45.35 
 
 
437 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  45.67 
 
 
444 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  49.5 
 
 
439 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  46.78 
 
 
441 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 
440 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  45.77 
 
 
445 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 
441 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 
441 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  48.22 
 
 
424 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 
444 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  49.65 
 
 
436 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  44.42 
 
 
440 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  50.91 
 
 
443 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  47.57 
 
 
437 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  45.72 
 
 
435 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  42.99 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  45.37 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  43.13 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  43.13 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  45.48 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  48.36 
 
 
439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  45.48 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  45.54 
 
 
454 aa  356  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  44.47 
 
 
472 aa  356  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  45.14 
 
 
454 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  46.12 
 
 
441 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  43.13 
 
 
440 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  45.48 
 
 
441 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  45.06 
 
 
441 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  42.69 
 
 
440 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  46.02 
 
 
440 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  45.3 
 
 
469 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  44.89 
 
 
441 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  44.89 
 
 
441 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  48.92 
 
 
441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  46.81 
 
 
462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  48.71 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  44.93 
 
 
459 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  45.3 
 
 
440 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  45.3 
 
 
440 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  45.3 
 
 
440 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  45.3 
 
 
440 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.3 
 
 
440 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  43.69 
 
 
435 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  45.3 
 
 
469 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  48.95 
 
 
436 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  48.95 
 
 
436 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  48.95 
 
 
436 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  48.43 
 
 
442 aa  350  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  48.24 
 
 
439 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  43.33 
 
 
453 aa  349  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  48.71 
 
 
436 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  49.06 
 
 
436 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  48.05 
 
 
441 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  47.57 
 
 
434 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  45.86 
 
 
442 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  45.67 
 
 
452 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  47.56 
 
 
441 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  47.56 
 
 
441 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  46.41 
 
 
441 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  47.32 
 
 
442 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  45.41 
 
 
443 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  46.41 
 
 
441 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  49.52 
 
 
433 aa  346  5e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  44.21 
 
 
436 aa  345  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  47.1 
 
 
436 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  44.21 
 
 
436 aa  345  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  47.56 
 
 
441 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  47.56 
 
 
441 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  44.21 
 
 
436 aa  345  8.999999999999999e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  46.84 
 
 
436 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 
439 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  47.57 
 
 
434 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 
431 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>