More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0840 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  100 
 
 
459 aa  908    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  52.13 
 
 
432 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  47.58 
 
 
432 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  49.01 
 
 
428 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  47.16 
 
 
433 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  46.74 
 
 
432 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  45.58 
 
 
432 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  49.36 
 
 
430 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  48.69 
 
 
437 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  49.23 
 
 
444 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  48.97 
 
 
444 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  46.76 
 
 
435 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  47.17 
 
 
443 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  45.22 
 
 
437 aa  362  9e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  43.23 
 
 
426 aa  362  9e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  44.99 
 
 
435 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  48.18 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  45.84 
 
 
440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  46.17 
 
 
442 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  44.15 
 
 
441 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  46.04 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  47.67 
 
 
430 aa  352  7e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.26 
 
 
437 aa  348  8e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  44.24 
 
 
440 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  44.89 
 
 
435 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  43.03 
 
 
449 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  46.93 
 
 
439 aa  347  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  44.66 
 
 
435 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  44.66 
 
 
435 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  44.36 
 
 
454 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  41.04 
 
 
433 aa  344  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  43.66 
 
 
428 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 
444 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  44.66 
 
 
435 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  44.34 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  44.34 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  45.11 
 
 
441 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.99 
 
 
436 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 
424 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  44.28 
 
 
432 aa  342  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  44.18 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  43.96 
 
 
450 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.49 
 
 
441 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.17 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  46.68 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.16 
 
 
436 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  43.66 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.16 
 
 
436 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  46.68 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  42.62 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  46.68 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  43.66 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  44.06 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  43.66 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  46.57 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  42.86 
 
 
436 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  44.36 
 
 
435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  46.67 
 
 
436 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.78 
 
 
439 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  46.01 
 
 
436 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  42.48 
 
 
441 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  45.09 
 
 
436 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.82 
 
 
469 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  43.71 
 
 
434 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.82 
 
 
440 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.82 
 
 
440 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.82 
 
 
440 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.82 
 
 
440 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.72 
 
 
441 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  43.99 
 
 
434 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.82 
 
 
440 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.06 
 
 
437 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 
441 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 
441 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  43.51 
 
 
434 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  43.02 
 
 
435 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2926  major facilitator transporter  43.45 
 
 
446 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.53 
 
 
439 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 
444 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
439 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  43.06 
 
 
443 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  39.91 
 
 
440 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 
444 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  39.44 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  39.44 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.41 
 
 
469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  47.12 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  39.86 
 
 
453 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  40.46 
 
 
445 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.57 
 
 
440 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  43.03 
 
 
434 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  43.03 
 
 
434 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  43.03 
 
 
434 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  41.88 
 
 
452 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.5 
 
 
440 aa  326  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  41.88 
 
 
452 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  39.81 
 
 
436 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.03 
 
 
442 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  40.52 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  45.75 
 
 
439 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>