More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5623 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  100 
 
 
441 aa  860    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  84.62 
 
 
441 aa  704    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  88.41 
 
 
444 aa  776    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  60.37 
 
 
459 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  62.56 
 
 
474 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  63.81 
 
 
459 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  63.81 
 
 
459 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  63.57 
 
 
459 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  61.83 
 
 
454 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  61.83 
 
 
454 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  57.11 
 
 
454 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  54.36 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  54.62 
 
 
444 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  54.87 
 
 
444 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  50.96 
 
 
432 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  47.28 
 
 
442 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  49.02 
 
 
432 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  50 
 
 
432 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  50 
 
 
440 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  48.54 
 
 
433 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  47.07 
 
 
432 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  47.28 
 
 
445 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  43.52 
 
 
440 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  51.4 
 
 
432 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  43.81 
 
 
437 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  44.77 
 
 
443 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  46.78 
 
 
428 aa  358  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  43.47 
 
 
454 aa  356  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  44.6 
 
 
444 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 
424 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  46.85 
 
 
441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  46.85 
 
 
441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  49.04 
 
 
435 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  43.06 
 
 
452 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  42.73 
 
 
440 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  42.86 
 
 
440 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  47.34 
 
 
435 aa  348  9e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  42.86 
 
 
440 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  44.79 
 
 
437 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  48.19 
 
 
435 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  47.49 
 
 
439 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  44.63 
 
 
437 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 
450 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  42.39 
 
 
440 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  46.29 
 
 
436 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  48.55 
 
 
443 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 
449 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  47.41 
 
 
439 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  43.91 
 
 
445 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  50.13 
 
 
437 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  47.7 
 
 
441 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  51.42 
 
 
436 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  45.84 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  44.21 
 
 
441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  42.99 
 
 
442 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  45.65 
 
 
436 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  45.65 
 
 
436 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  45.14 
 
 
453 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  43.99 
 
 
441 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  45.41 
 
 
436 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  52.38 
 
 
436 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  44.33 
 
 
469 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  44.44 
 
 
441 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  50.35 
 
 
436 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  44.33 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  44.42 
 
 
442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.81 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  44.33 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  44.33 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  44.33 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  44.33 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  44.09 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  44.09 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  52.14 
 
 
436 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  43.26 
 
 
441 aa  339  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 
433 aa  338  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  44.09 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  51.81 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  44.92 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  43.6 
 
 
469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 
440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  51.89 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  47.21 
 
 
444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  51.89 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  51.89 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  45.09 
 
 
440 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.24 
 
 
441 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  43.84 
 
 
441 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.37 
 
 
443 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  47.23 
 
 
456 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  51.81 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  43.84 
 
 
441 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  43.24 
 
 
441 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  43.84 
 
 
441 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  43 
 
 
433 aa  333  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  44.31 
 
 
459 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.67 
 
 
451 aa  333  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  44.26 
 
 
445 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  46.59 
 
 
452 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  42.76 
 
 
443 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>