More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8320 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4137  major facilitator transporter  86.01 
 
 
439 aa  725    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  79.67 
 
 
440 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
444 aa  881    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  89.88 
 
 
439 aa  759    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  58.91 
 
 
440 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  58.91 
 
 
440 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  58.43 
 
 
440 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  59.33 
 
 
440 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  58.19 
 
 
440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  62.69 
 
 
441 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  62.69 
 
 
441 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  51.29 
 
 
440 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4836  major facilitator transporter  53.16 
 
 
452 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  50.12 
 
 
432 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  50.81 
 
 
435 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  49.65 
 
 
472 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0776  major facilitator transporter  51.75 
 
 
439 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  49.88 
 
 
432 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  48.43 
 
 
443 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  48.26 
 
 
432 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  46.85 
 
 
432 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  46.98 
 
 
433 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 
432 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  50.63 
 
 
437 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  47.66 
 
 
428 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 
450 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  45.35 
 
 
454 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 
444 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  44.67 
 
 
441 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  47.41 
 
 
445 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 
430 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 
444 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  45.9 
 
 
441 aa  339  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  47.07 
 
 
444 aa  338  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  45.77 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  46.57 
 
 
436 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  42.01 
 
 
444 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  46.57 
 
 
436 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  45.81 
 
 
436 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  47.45 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 
431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  41.27 
 
 
442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  46.12 
 
 
436 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  46.12 
 
 
436 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  46.12 
 
 
436 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  44.81 
 
 
436 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  45.92 
 
 
431 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  41.96 
 
 
435 aa  323  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  44.44 
 
 
459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  43.42 
 
 
453 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  44.01 
 
 
439 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.3 
 
 
437 aa  315  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  47.51 
 
 
443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  41.12 
 
 
433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  41.77 
 
 
443 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  44.2 
 
 
474 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 
433 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4806  major facilitator transporter  44.15 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5398  major facilitator transporter  44.15 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5463  major facilitator transporter  44.15 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  normal  0.056978 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5948  major facilitator transporter  47.24 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00781497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  40.85 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4805  major facilitator transporter  43.72 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.55 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5346  major facilitator transporter  43.72 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  40.83 
 
 
440 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4875  major facilitator transporter  43.23 
 
 
459 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  40.83 
 
 
441 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5395  major facilitator transporter  43.23 
 
 
459 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  41.73 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.31 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5467  major facilitator transporter  43.23 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129011  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  41.31 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  40.89 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  41.31 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  42.49 
 
 
440 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  39.58 
 
 
442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 
449 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  41.12 
 
 
442 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  39.82 
 
 
437 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  44.42 
 
 
436 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  40.75 
 
 
441 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  42.14 
 
 
435 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  43.09 
 
 
441 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 
440 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  43.11 
 
 
435 aa  299  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8308  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
435 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 
424 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 
440 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  41.46 
 
 
441 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  40.34 
 
 
443 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  41.46 
 
 
441 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  39.82 
 
 
440 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  41.22 
 
 
441 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  40.83 
 
 
442 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 
440 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  41.93 
 
 
442 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>